机关兵需要人操控，丘叔演苦肉计不参加战斗正好操纵机关兵，不然边打边操纵容易露馅。
有这样一段文本“这些机关兵究竟是谁操纵的，和普通的有天壤之别。”可以看出操纵这些机关兵的是精于机关术的高手。
同时机关兵的操纵者不能离机关兵太远，因此这些机关兵是由离得近的机关术高手操纵的。
于是基本可以推出丘叔就是冬校机关兵的操纵者。
故意被机关兵射伤一是好专心操控机关兵，二是作为苦肉计为自己洗脱嫌疑，好算计。

很合理

你想多了。这又不是查克拉线。第二年有交代。机关人如果不是可以无线接受精神控制，要不就是内有高科技的敌我识别系统。上官煦家宴情节，不就是用了个控制板按钮什么的吗？而且那人位置距离上官府邸起码有个一公里。
第一年丘叔作为一个头领，不可能四处跑去控制机关人。这种难以解释的事情不用太纠结，纠结来就是BUG。