RNA提取常见问题分析
aglaia吧
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Iaglaia 楼主
提取过程中RNA降解 1、样品中的RNA发生降解 尽量选择新鲜的样品,样品采集后应迅速用液氮处理。 材料保存在液氮中或-80℃条件下,材料均不宜长期保存,且避免反复冻融。 幼嫩新鲜的材料RNA含量高且完整,衰老或病害等受损的材料中RNA降解比较严重。2、操作环境的RNase污染 RNA提取尽量选择洁净的环境,由于自然条件下空气中含有较多的RNase,建议对提取环境进行RNase的清除处理。 3、提取用具带来的RNase污染 提取用所有的玻璃器皿可通过高温灭活(160℃烘烤4-5 h)去除RNase。 RNA样品所接触的所有塑料制品(如枪头、电泳槽、移液器等都需要通过DEPC或NaOH处理严格去除RNase后才可使用 4、RNA溶解用水带来的RNase污染 配制DEPC处理水时需剧烈振荡使DEPC与水充分接触反应(DEPC与水反应后会产生大量的气体,可用塑料膜将瓶口扎紧,剧烈混匀后通过观察塑料膜是否胀气来判断反应是否充分)。 DEPC处理后应避光静置过夜,高压灭菌。 5、操作中带入的RNase污染 人的皮肤、汗液和呼出的气体中含有大量的RNase。操作人员可通过经常更换一次性手套,佩戴口罩等措施减少此类污染。 RNA提取量低 材料RNA含量较低 对于RNA含量较低的纤维组织(肌肉组织或纤维素较高的植物组织)可适当提高起始材料的用量。 材料中蛋白和脂肪含量较高 蛋白和脂肪含量较高的材料可用氯仿对上清再次抽提。 RNA沉淀条件不合适 使用异丙醇沉淀RNA中,加入的异丙醇与提取液的比例为严格的1 :1 ,否则会明显影响RNA沉淀的效率和RNA的纯度。特殊材料(如含有多糖、多酚等)可通过添加适量的柠檬酸钠来改善沉淀效果。 RNA中有基因组DNA 污染 材料中核酸含量高 脾脏、胸腺等组织中的核酸含量较高,可进行多次酚氯仿抽 提以去除多余的DNA。也可以在提取后加入DNase处理,降解DNA 。 RNA沉淀条件不合适 使用异丙醇沉淀RNA中,加入的异丙醇与提取液的比例偏高溶液的pH值偏小,都容易使DNA形成沉淀。 提取后的RNA样品降解RNA样品反复冻融 反复冻融会使RNA片段断裂,影响RNA的完整性。 RNA样品保存条件不合适 根据保存时间和材料的不同RNA应保存在不同的溶液中。如从胰脏、肝脏等RNase含量较高的材料中提取的样品需要储存在甲醛或甲酰胺中以保存高质量的RNA,而在脾脏中提取的RNA可在水中长期稳定保存。
2008年05月25日 06点05分 1
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Iaglaia 楼主
RNA酶极不易灭活,在提取RNA的过程中,普通玻璃器皿和塑料制品经常有RNA酶污染,使用前必须经过处理。灭菌的一次性使用的塑料制品基本无RNA酶污染,可以不经过预处理而直接制备和贮存RNA。实验室的普通器皿和塑料制品使用前必须于180℃干烤8小时或更长时间(玻璃器皿)可用氯仿冲洗(塑料制品)。另上较常用的方法是用0.1%的DEPC水溶液浸泡用于制备RNA容器。灌满DEPC的容器于37℃保温2h以上,然后高压灭菌,枪头也需高压灭菌。
2008年05月25日 06点05分 2
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提RNA,想简单点。就找北京华越洋生物公司的RNA提取试剂盒,用了那么多公司盒子。到最后才找到一个真正质量好,人家价格还不贵,服务态度也好。还是国产的。现在TMD的假货次货太多,运气好能找到好的,运气不好,买的全是次货,搞到最后还以为自己不会提。去
2011年03月03日 02点03分 3
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RNA降解,用外源RNA酶清除剂哟
2011年03月03日 02点03分 4
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