bool HeroLayer::init(){
bool isinit = false;
do {
CC_BREAK_IF(!BasicLayer::init());
//创建主角
hero = CCSprite::create("hero.png");
hero->setAnchorPoint(ccp(0.5,0));
hero->setPosition(ccp(getWinSize().width / 2, getWinSize().height / 2));
this->addChild(hero);
this->setTouchEnabled(true);
isinit = true;
} while (0);
return isinit;
}
bool HeroLayer::ccTouchBegan(CCTouch *pTouch, CCEvent *pEvent){
CCMoveTo* move_action = CCMoveTo::create(0.3f, pTouch->getLocation());
hero->runAction(move_action);
hero->setPosition( pTouch->getLocation());
return true;
}
void HeroLayer::registerWithTouchDispatcher(void){
CCDirector::sharedDirector()->getTouchDispatcher()->addTargetedDelegate(this,INT_MIN+1,true);
}

把头文件也发上来看看，是不是ccTouchBegan没写virtual void之类的错误？
PS. 对hero运行过move_action之后就不用再次setPosition了，hero->setPosition(pTouch->getLocation());一行可去掉
另外可以在ccTouchBegan的开头加上CCLOG("HeroLayer: touch began")来看是否是真的没有响应

//
// Created by mxdy on 14-1-7.
//
//
#ifndef __FlyCoCo__GameLayer__
#define __FlyCoCo__GameLayer__
#include <iostream>
#include "BasicLayer.h"
#include "HeroLayer.h"
USING_NS_CC;
class GameLayer:public BasicLayer{
public:
GameLayer();
~GameLayer();
static CCScene* scene();
virtual bool init();
CREATE_FUNC( GameLayer );
virtual void onEnter();
virtual void bg_scroll_callback(float t);
private:
HeroLayer* herolayer;
};
#endif /* defined(__FlyCoCo__GameLayer__) */

是不是加上CCLOG以后，日志窗口里没有信息？
如果是这样的话，需要检查一下BasicLayer的声明（是否重载ccTouchBegan, registerWithTouchDispatcher等），实在不行可以尝试在HeroLayer,GameLayer和BasicLayer声明里加入
public:
virtual bool ccTouchBegan(CCTouch *pTouch, CCEvent *pEvent);
virtual void registerWithTouchDispatcher();
或者如果使用cocos2d-x v3.0的话，用新的EventDispatcher，可以在官方网站上找到示例
如果日志窗口里有信息，但hero没有移动，那应该是ccTouchBegan这个方法内部的问题，建议检查该方法的实现是否有bug。
(好像头文件发错了，源码是HeroLayer的，但头文件是GameLayer的)