2009年，地球上的人类首次与外星人接触。同年，与天顶星人军队爆发宇宙战争，使得地球人一度濒临灭亡的危机。
2010年3月，战争宣告结束。同年4月，新统合政府成立，当时的地球人与外形的天顶星人步上了和平共存的道路。天顶星人可以志愿申请，藉由微缩化的技术让身体变得和地球人一样大小。
2011年9月，地球统合政府考虑到种族存亡的问题，提出人类移民计划。隔年9月，第一批超长距离移民船团，美卡罗特一号正式起航。
2030年9月，超大型移民船新超时空要塞一号舰代替美卡罗特大型移民船出航，那是规模高达百万人口的移民船团。
2038年，以新超时空要塞七号舰为核心的第三十七批次超长距离移民船团，超时空要塞七号舰，向着银河的中心，踏上了漫长的旅程。
然后到了2045年的时候......