1.准备新版的安装文件，一定要最小安装，能够保证能够播放就行；
2.打开老程序的文件夹，复制想升级的FB文件夹components（插件）、configuration（配置）、user-components（用户插件）、themes（或者skins、images、DarkOne或其他文件夹）内对应皮肤包，并且包含***.fcl文件，如果没有此文件就打开FB，在分栏用户界面内 导出 一个fcl格式文件，好给升级时准备；
3.有部分插件会记录版本信息，一定要删除，通常在components、user-components内的某文件，比如core.dll、foo_fileops.dll、foo_converter等和对应的配置文件
4.FB最初安装的是“默认用户界面”，我们想要的是“分栏用户界面”所以新的文件里面最基础的就是foo_ui_columns.dll必须有，有了它，在打开FB文件时，就会进入“默认用户界面”和“分栏用户界面”的选项，选好后会生产一个config.sqlite，在升级界面不成功时，可以把此文件删除，重新选择“默认用户界面”，只要没有删除源程序的文件或者被替换，源程序界面不会受到影响；
5.简单的升级皮肤，一次就会进入并成功，部分dll插件文件会由于版本的兼容问题需要对应的功能文件，版本可能就是原版本前后的版本，一般会有提示，根据提示寻找到合适的版本就会成功升级；最困难的选择进入“分栏用户界面”后没有反应，不知道的原因导致升级不成功。
6.对于简单的，可以把这些文件保留下来，形成升级包，只要复制到新版FB文件夹内，即完成了升级；
7.稍难些的就需要改脚本了，大部分人已经不会了。
8.对于删除的文件要保留好备份。。。
可能有些说的不是很清楚，自己揣摩一下，多试几次，一点会成功的，对于缺少的关键插件，导入不成功的时候会有提示的。进入更新版本的界面之后，就可以升级里面就得插件了。

安装新版时，安装最小版本的原因是防止新安装的插件和老版本有同样的插件，而产生冲突。复制老版本的文件到新版本的文件夹时，如果有同名的，一定要跳过去，因为新版本最小安装时，安装的插件都是最基本的关键插件，否则会产生新版本的fb2k打不开的问题。
有简单的皮肤不需要configuration里的文件，有的则非缺不可，必须复制进去，至于播放列表和其他不关键的文件夹，复制进去和不复制进去不会有关键问题。

没看明白

楼主的意思是如何对分栏用户主题界面的定制版进行FB2K主程序进行升级，如从2.24.6升到2.25.2。个人经验是先将定制版移值到FB2K默认安装路径下，以后直接在已有定制版基础上覆盖安装新版FB2K实现主程序不断升级。

直接覆盖安装就可以，只是安装时不勾选配置文件，覆盖后就保留了原配置，一个好习惯就是覆盖前备份一份。