肛瘘又称肛管直肠瘘，是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要侵犯肛管，很少涉及直肠，故常称为肛瘘，内口多位于齿状线附近，外口位于肛周皮肤处。整个瘘管壁由增厚的纤维组织组成，内覆一层肉芽组织，经久不愈。发病率仅次于痔，多见于男性青壮年，可能与男性的性激素靶器官之一皮脂腺分泌旺盛有关。

按瘘管位置高低及数量分类
低位单纯性肛瘘
内口在肛隐窝，仅有一个瘘道通过外括约肌皮下或浅部，与皮肤相同。
低位复杂性肛瘘
有两个以上内口或外口，肛瘘瘘道在外括约肌皮下部和浅部。
高位单纯性肛瘘
内口在肛隐窝，仅有一个瘘道，走行在外括约肌深层以上。
高位复杂性肛瘘
有两个以上外口，通过瘘管与内口相连或并有支管空腔，其主管通过外括约肌深层以上。

按照瘘管与括约肌的关系分类
肛管括约肌间型
即低位肛瘘，是由于肛管周围脓肿导致的，会位于内外括约肌之间，内口于齿线周围，外口于肛缘附近，约占肛瘘70%。
经肛管括约肌型
可为低位或高位肛瘘，因坐骨肛管间隙脓肿导致，瘘管穿过外括约肌、坐骨直肠间隙，开口于肛周皮肤上，约占25%。
肛管括约肌上型
比较少见，即高位肛瘘。瘘管在括约肌间向上延伸，可越过耻骨直肠肌，向下经坐骨直肠间隙穿透肛周皮肤，约占4%。
肛管括约肌外型
最少见。多为骨盆直肠间隙脓肿合并坐骨直肠间隙脓肿的后果。治疗困难，仅占1%。