先整体说下剧情感受吧，第一、第二季和第三季前半部分节奏很好，第三季后半部分个人觉得太赶了。如:
1，恶魔社的重要角色没有铺垫，也没有交代身份背景，以及渗透程度。
2，室长是不是唯一最大的？当时软禁白亚是否可以理解为，驱魂队基本都是恶魔社的，室长明白但是无力回天，所以才软禁白亚为了保护她？
3，白亚竟然是恶魔学院第一位自己召唤出镰刀的，结果前面都没提到，有点临时加设定之嫌。
4，二阶堂老师貌似是地狱方面的人，但是为啥她高中同学就是普通的实习女教师？以及最后一直观察旧地狱的小女孩貌似是个地狱大人物，身份也没有介绍。
5，为什么学园的徽章是六角形，貌似和地狱有关系，但是也没有展开。
6，金发双马尾和结的第一次攻略直接没了，第三季开头好几位女孩草草带过，结果前面看的太突兀了。
总体来说盲猜原本剧情是要出第四季，结果临时改了所以第三季才基本省略了以上剧情。
然后再说说主要女角色吧
1，妹妹。一开始民喜肯定是想过妹妹当女主角的，毕竟浴室已经表明妹妹有那方面心意了。结果后面越写越天然，越来越边缘。一开始还有黑暗料理+打扫的特点，出场也比较多，第二季初遇白亚算是高光时刻，但是整体来说就是个卖萌角色，第三季直接全程路人了，最后就真的成妹妹了。
2，天理。按道理说天理是喜欢男主最久的，毕竟从小学就开始了，而且是自己主动喜欢上的，这算是标准青梅了吗？但是天理存在感太低了，过于害羞被动，不像千寻很多次主动向男主表白，而且有一半风头还被狄安娜抢去了，所以只能败犬了。事实说明恋爱的时候一定要主动啊（话说，现在意识到这点是不是太晚了……）
3，狄安娜。喜欢上男主的女神，也是目前来说最正常的女神，所以也有一定的人气，但是喜欢归喜欢，实际普通人想和女神在一起的可能性基本为零。普通后宫漫也许会安排个大团圆结局敷衍过去，但《只有神》不会。所以说，有缘无分。
4，白亚。个人很喜欢的女角色（傲娇永不退环境），而且能力比妹妹不是一个级别的（就像你本来用着诺基亚打王者，突然换成黑鲨手机，才发现原来可以这么流畅，这么丝滑）开个玩笑。但是白亚也基本不可能，因为妹妹设定喜欢男主和吃醋白亚的，白亚不可能越过妹妹和男主在一起，加上男主心中对白亚也没有特别在意，所以基本也不可能了。喜欢白亚的话可以把那次沙盘模拟男主和白亚做的事当成结局。
4，步美。第一位被攻略的女角色，也是女神之一。第三季剧情如此紧凑的情况下步美的攻略竟然有条不紊，相当于其他两个女神的攻略长度，一波三折也算给足了面子。某种意义上来说是进度最高的，毕竟都谈婚论嫁了，但是男主回答“不喜欢”的那一刻，就已经明白结局了。
5，天音。同步美，也是被攻略角色中主动表白男主，偶像的帽子对冬弥可能是负担，但是对其他人来说确实羡慕嫉妒恨，尤其是班上公开表白，班级同学大吃一惊的时候，也算是为数不多的爽点吧，毕竟男主做事一向低调。属于高人气但是并非最后女主。
6，千寻。很多人觉得漫画结局是草草收尾的，原本不该选千寻，我觉得不是这样。众所周知作者之前想女神篇就完结，结果因为出版社一通骚操作搞得狗尾续貂。但是节奏乱了，不代表结局是错的，既然准备完结，肯定早就想好了结局，只能说没有铺垫好，导致有人不能接受千寻。早在第二季千寻登场就说明不一般了。普通，没有特点，现实女，无从下手？这些都是男主不擅长的，也只有这样，像千寻这种女孩的表白才能让男主刻骨铭心。还记得男主最喜欢的那个小四妹，其他都不能接受的画风，在男主心中就像唯一真神。也许，历经千帆归去，方得平淡是真吧。
毕竟，在一众闪耀的偶像、女神中，那个平凡且普通的女孩，在春天，一切还未开始的时候便悄然喜欢上了桂木。就像你一直以为邻桌和你吵架的女生，原来一直在心里喜欢你一样。陪你疯，陪你闹，陪你去追其他女孩子，哪怕明知自己心意，哪怕已经被拒绝，还是勇敢地去表白。在一众梦幻般的女孩子中，只有千寻是最真实的那个女孩。

观点居然和我都差不多楼主可以考虑考虑继续看漫画

女神篇动漫删了挺多内容的，很赶。不然12集拍不完。至于你说的很多伏笔，有几个分镜有明显的提示，还有的是为最后一个篇章做铺垫的。有兴趣的话可以去补一补漫画

类似这样的伏笔分镜还挺多的，动漫我记得第二张图是有的吧。

腰斩这么多你还想要连贯，算了吧

漫画有你要的答案

1，动漫第二季到第三季剧情隔了漫画五到十二卷差不多有七卷没做，恶魔剧情讲的肯定不完整
2，室长是最大的，但是驱魂队有旧恶魔的内应，所以室长不能完全掌控驱魂队
3，漫画有说，动漫第二季到第三季中间跳了差不多七卷漫画，同1
4，大骷髅分身
5，漫画也没说
6，同1、3，女神篇只讲了六个主要角色剧情还算比较连贯了，要知道动漫没做的七卷漫画中间隔了9个角色没做（动漫第三季神大人和白娅排除女神的时候拿过一张纸，纸上写的就是一共16位攻略对象），要是能都做公司也不至于倒闭

一直觉得艾露西和白亚两个的人设基本互补，完全可以合成一个，这样就相当于普通王道漫的女主角了。
但是如果这样，就没有选普通角色通关的机会了，选千寻面向现实应该是早就定好的结局，说实话实际操作得不好。