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希奈丝特拉成功的由虚空龙的力量制造出更强大的变种龙暮光龙，但是被卡雷苟斯、克拉苏斯、罗宁和温蕾萨等英雄破坏而被认为已死，然而死亡之翼却悄悄的接手暮光龙的实验。罗宁回到重建完成的达拉然成为新任领导者，面对蓝龙王突然对所有法师宣战，新的达拉然城市成为天空飘浮的堡垒飞往诺森德，奥核之战开始。吉安娜和艾格文发现潜藏在麦德安身上的力量和家世，开始与梅里·冬风共同重组提瑞斯法议会，广大招收各界法术的强者，守护者为麦德安。接着麦德安带领提瑞斯法议会在艾格文的牺牲下击败食人魔古加尔。维库人从万年的长眠中醒来，接受永生的保证而加入巫妖王的
天灾
军团。但是部落和联盟达成合作协议，攻破了维库人之城乌特加德要塞。巫妖王阿尔萨斯带着达里安·莫格莱尼与众多的死亡骑士来到东瘟疫之地，意图剿灭银色黎明和
血色
十字军，但是许多的血色十字军也已经放弃此地直接进行北伐，为血色先锋军。圣光之愿礼拜堂一战，阿尔萨斯败逃于提里奥·弗丁。提里奥·弗丁以重新
净化
的圣剑灰烬使者为名，将银色黎明重组为银色北伐军。达里安带着大量得到自由的死亡骑士筹组黑锋骑士团，派出库尔迪拉为部落
特使
、萨萨里安为联盟特使与双方结盟一起北伐。德拉诺什·萨鲁法尔带领部落军队封锁住所有艾卓-尼鲁布往地上的通道，并且击杀阿努巴拉克；同时伯瓦尔·弗塔根也带领联盟的军队攻陷纳克萨玛斯，再度击败巫妖克尔苏加德。部落与联盟联手进军冰冠堡垒，却在天谴之门遭受背叛者普特雷斯的袭击，大量军力惨遭灭亡，德拉诺斯战死、伯瓦尔也被认为已死。幽暗城一战，大酋长萨尔与被遗忘者
女王
希尔瓦娜斯击杀叛徒瓦里玛萨斯，暴风国王瓦里安则成功的复仇解决普特雷斯，但是联盟从此对部落正式开战。玛里苟斯被红龙女王阿莱克丝塔萨带领龙眠联军打倒，魔枢停止继续抽取奥术能量，奥核之战结束，之后蓝龙族派卡雷苟斯担任蓝龙大使。大探险家布莱恩·铜须发现奥杜尔的
秘密
与血肉
诅咒
的真相，在达拉然与冒险者的协助下解救所有被
控制
的泰坦看守者，杀死上古之神尤格-萨隆。布莱恩在众英雄的协助下成功的证明凡人的意志和力量，让泰坦的使者奥尔加隆发出艾泽拉斯是安全的讯息给万神殿，免除世界
毁灭
的灾难。银色北伐军和黑锋骑士团组成灰烬审判军，带领部落和联盟对冰冠堡垒进行最后的攻城，希尔瓦娜斯·风行者和吉安娜·普罗德摩尔则分别带领小队的队员从旁切入，发现了霜之哀伤的秘密。灰烬审判军攻入冰冠堡垒，提里奥·弗丁于冰封王座上击碎阿尔萨斯的霜之哀伤，阿尔萨斯败亡，由先前未死的伯瓦尔·弗塔根接任巫妖王。继任之后巫妖王再度陷入沉睡，天灾之战结束。部落与联盟在诸多势力的调解下停战并签订互不侵犯的和平条约。