根据电视剧《神探狄仁杰》中的情节，刘传林确实在剧情中被武则天下令斩首，但他并没有真正死亡。在后续的情节中，揭示了一个更加复杂的阴谋，原来刘传林曾经与高力士合谋，在自己的膝盖上放了一颗药丸，以假装自己已经死亡，从而躲过死亡的命运。最后，狄仁杰发现了这个阴谋，并成功将真相揭露出来，同时也为刘传林洗脱了罪名。因此，尽管刘传林在剧情中遭到了指控和威胁，但他最终还是得以幸免于难。