先套盾，完全是个人理解
可能说的不是特别清楚

lz
简单思考了一下，为什么魔女的研究设施会在教堂底下，然后想到了一个可能的结论，就是教堂实际上已经和部分魔女之间达成了某种协议，借由狩猎来给研究机构提供原料，让魔女来进行克隆实验
或许主角确实有荆棘魔女的血统，所以被当做母体拿来克隆了，而且很明显研究所里的魅魔长得似乎和主角一样，感觉可能就是魔堕的实验体，也是导致这场魔堕的元凶，当然归根结底还是源自于教会和魔女的实验
事故发生以后大多实验体都跑了，除去被救出来的主角只剩下失败品和魅魔。剩下的一部分跑到了水晶洞里，另一部分被牧场抓了（牧场里有好几个和主角一样发型发色的，当然也有可能是作者懒），水晶洞里那个祈祷少女没记错的话好像在介绍里说就是实验体，荆棘魔女的大剑也插在那边，所以我觉得是这样

为什么没人水

魅魔是司书搞出来的，是召唤出来的，你可以理解为借司书他们搞得恶魔魔法研究降临于世间的恶魔

荆棘魔女是被干掉了才成为实验样本试图复刻的

荆棘魔女与魔物的暴发之间可能存在某种联系，从时间上看她与恶魔入侵的时间差不大，另外从意象上看她也是游戏性与血腥暴力的总体现。说到底作者没过多展开世界观，只能靠自己脑补了。