进口原材料时，不仅要向海关缴纳关税，海关还要代开增值税发票。关税不可抵扣，进入库存成本；增值税是可以抵扣的税种，不计入库存成本。一般情况下，关税和增值税发票是同时拿到，且都为本位币。

在普通的采购过程中，增值税是由供应商代收的。在给供应商的应付中包含货物价值和增值税。而在进口业务中，货物价值是给供应商的，而增值税却是要交给海关（或者清关代理）的。即使是交给清关代理，清关代理与供应商也不会是同一个单位。对供应商要以外币付款，对增值税（及关税）要以本币付款。对于可抵扣的增值税可以手工借记增值税，贷记应付（海关）；对于关税需要通过“后继发票”的方式计入库存成本。为简便起见，可以将增值税和关税都做在“后继发票”上。