吧里有没有做生信的？龙芯的系统能运行生信软件吗？
龙芯吧
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level 5
究极霸王龙 楼主
用conda可以在龙芯的linux上装各种软件吗？R语言各种包可以正常安装吗？
2022年11月21日 20点11分 1
level 6
银树苍穹
应该不能，目前conda官方还没支持loongarch，应该只能自己编译安装。可能可以使用二进制翻译运行x86的linux软件。
2022年11月23日 05点11分 2
究极霸王龙
好吧，那看来是用不了了[汗]
2022年11月23日 08点11分
银树苍穹
从github看，龙芯中科的人在做相关的工作，但是目前似乎停滞不前了。
2022年11月23日 09点11分
银树苍穹
@究极霸王龙 生信软件应该还是可以运行的，编译安装或者二进制翻译。
2022年11月23日 09点11分
究极霸王龙
@银树苍穹 回复 银树苍穹 :编译安装最大的困难就是报错了不知道咋办，我平时用ubuntu网上一搜还是有教程，毕竟自己不是大佬[泪]
2022年11月23日 11点11分
level 8
zelardo
生信是啥，是生物信息吗？conda 和r都是开源的，问题应该不大吧，只是没有人搞过可能搞起来麻烦。给龙芯官方反应一下，看看有没人搞一下把它们上架到应用市场。
2022年11月23日 08点11分 3
究极霸王龙
是的，但是生信相关的软件太多了，而且更新换代也贼快
2022年11月23日 11点11分
zelardo
@究极霸王龙 宝德新发布的龙芯服务器提到了生物和医学的，他们假如想开拓这方面的市场应该会根据客户要求移植些对应的软件的吧。
2022年11月23日 16点11分
level 13
桜坂_工兵
conda暂时没进度，我去推了一把，裸的 pip 可以用
R没试过，估计能用，不能用估计也好移植，这种科学计算组件一般不太架构相关
2022年11月23日 09点11分 4
level 5
究极霸王龙 楼主
我个人觉得，我们生信分析需要的是多核心，64核起步，高内存，128G起步，频率其实不重要，2-3G足够。我现在用的志强也就这个水平。如果生信软件都能跑，或者至少需要长时间运行的比如序列组装，序列比对，同源比对这种软件能跑，那完全可以支持一波。大家搞科研都有经费，买个小服务器的💰还是有的。
2022年11月23日 11点11分 5
Jugg🔥
核心数不是问题，4路3C5000应该可以
2022年11月23日 11点11分
究极霸王龙
@Jugg🔥 所以我说软件适配上去的话生信是很适合用龙芯的，不用高频率，也不用显卡
2022年11月23日 15点11分
level 12
哦iu一套软件
龙芯的底子就适合干科学计算的活
2022年11月23日 15点11分 6
level 1
帕非洛尔🍼
r的本体源码挺少的，而且还是开源的，改改重新编译问题倒是也不大
不过难支持的应该是cran上的那些包，纯r的倒是问题不大，就怕那种用了c或者jvm模块的
2022年11月24日 03点11分 7
究极霸王龙
对，就是这样，现在的包越来越臃肿了
2022年11月24日 10点11分
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