主角铃木龙一是个富二代，一场海难后性情大变，成为了假面骑士Sail。
亚特兰提斯（Alantis）是一个消失了的海洋帝国，并且将所有驶入他们禁忌海域的人制造海难，并对他们进行改造，因为亚特兰提斯企图重回陆地，因此需要找到一片陆地进行进攻夺取成为他们的国度，而日本就是他们的目的。然而发动战争他们却缺乏兵员，于是就要改造一些地上人类来增补兵员，铃木龙一正正是其中之一。
被改造后的龙一夺走了其中一艘亚特兰提斯船，并且偷走了高级战士（假面骑士）的变身器，并变身假面骑士Sail与他们展开恶战……

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