区别是一个用魔法，一个用炼金术，一个用巫术

猜测：魔法是不可触摸的非实体的，比如火焰，光；炼金术是生成可触碰的物体，比如土、金属；巫师是驱使使魔的，祭祀之类的

魔法师用手杖，炼金术靠磕药和道具，巫师走仪式。
感觉就是咱们用符、用丹和用阵法差不多

按传统神秘学
魔法是对世界上各种力量（天使、恶魔)相位（天堂、灵界、地狱)力量进行研究调用。
炼金术是对以自身智慧对奇迹的追求，不同的学派对追求不太一样，包括但不限于:炼铁成金、生命创造、第二世界、天使升华。
巫术是对世界本身或者神明的模仿与侍奉。
用的的时候分的也不是太清，炼金术是也会参考魔法和巫术，魔法师也不介于学习炼金术加到自己理论里。

我觉得巫师魔法师有时就是翻译的问题，概念差不多
翻译习惯上通常把玛雅或者非洲、北美土著这种古老一点文明使用的”witchcraft“ 翻译成巫术。
然后欧洲的梅林这种用的“witchcraft ”翻译成魔法。
至于炼金，单提出来说，应该是东方文化二次创造的结果，西方大多好像不单整个分支出来。就好比武侠小说里，轻功内功拳脚功夫，高手都会，要练一起练，一般没人光练一种 。
本身都是多元文化碰撞又融合再二次创作，又是偏向幻想世界的内容，不同世界观里定义不一样，应该不会有个能为你提供标准答案的

magic、witchcraft、wizardry、sorcery感觉这些词好像也没太明显的区分。
有人觉得magic是魔法，其它是巫术。
但你看Hogwarts School of Witchcraft and Wizardry应该是魔法学院还是巫术学院呢？
哈利波特，翻译用巫师，但我们印象里应该更偏向魔法师对吧，楼上还有人说用魔法杖的是魔法师。
外来词本土重新演义，全看作者怎么定义了

魔法师擅长魔法
炼金术师比较稀有，好点的去做医学方面的，邪恶的提炼原油、磨练毒水等
巫师这也是个很广泛的职业，例如南洋百骨、化术

漫画没有细节说明，

一人里面炼金术与人体炼成好像是分开的流派，但我看大部分作品里人体炼成都算是炼金术的极致了

按我以往看的西幻设定，猜测分类是这样，
魔法师，成体系的魔法使用者，类似于元素，咒法之类的法术使用者
炼金士，魔法物品，制造特长的法师，专精于制作魔法物品和练成魔法材料
巫师，偏向于诅咒，通灵等更玄秘的魔法道路

二叔这边设定的话，魔法应该就是用魔杖放法术，厉害的魔法师可以无杖施法，炼金术士应该就是玩人体炼成的，至少从之前安东尼和悟的对话来看魔法师和人体炼成算是翡翠学会的招牌，巫术目前还不清楚，目前唯一一个表现的比较清楚的是那个影子刺客的黑巫术，和灵魂相关，此外学会的理事斯宾塞称神树为自己知道的最伟大的巫术，所以神树的本质大概也是某种巫术，不确定和灵魂有没有联系，要是有的话那老青在这一篇的出场就有意思了

综合大家的说法，魔法师用的是自然魔法力量，金木水火土光暗等。炼金术师用的是科学魔法力量，炼器，防具，丹药等等。巫师用的是非自然魔法，和邪恶信仰有关。

咒语，魔药，仪式