引发睡眠障碍的原因比较多，但睡眠障碍的具体发病机制尚未完全清楚，不同类型的睡眠障碍其原因也不相同。
目前已知睡眠障碍可能与下列因素有关：
* 精神心理因素：常处于焦虑、紧张不安的情绪中。
* 疾病因素：例如疼痛性疾病、精神相关疾病等。
* 药物因素：某些药物可能会有致兴奋作用，比如糖皮质激素、甲状腺素等；饮酒或是安眠药有催眠作用。
* 生理因素：不规律的生活作息、时差、睡眠环境改变以及不良的生活习惯等。