据《金陵梵刹志》卷九记载，高桥门外云居寺，属小刹，西距明都城正阳门四十里，西南距所领翼善寺三十里。云居寺旧在钟山之麓。关于此寺移建年代，《金陵待征录》认为系“明时移旧额建于淳化镇北”，但具体年代无考。据明人周晖《金陵琐事》记载，“云居寺古松”曾被盛时泰列为金陵南郊十景之一。又据清《金陵诗徽录》载：云居寺为明所建，属灵谷寺所领四小寺之一。1904年重新修造过的云居寺现存大殿一座，后殿一座以及大殿东侧僧房五间。大殿面阔17.9米，进深15.9米，后殿面阔18.3米，进深9米。大殿屋脊尚存藏传佛教六字真言：“唵、嘛、呢、叭、咪、吽”。这座大殿与后殿之间进深47米，占地面积约1000平方米，大殿有单轩，梁柱上有精美木雕。现存建筑虽为晚清、民国时期重修，但依稀可辨当年寺庙格局及规模。

南京云居寺
南京阀门厂厂区的正中心位置，经一道2米高的围墙分割，通过园门穿过围墙，一条长约20米的巷道，看见云居寺现状，占地面积约2亩，杂草丛生，一片荒芜。院内有一石碑，上书“云居寺”。庭院杂草杂树丛生，枯藤老树交织缠绕，法桐树落叶积厚，蔷薇、棕竹等植物肆意生长，园路完全被侵占甚至覆盖，建筑材料（平瓦、红砖等）随意堆放，现状一片狼藉。
现存第二进、第三进和辅房，第一进已不复存在。
第二进为大殿，东边两间的屋顶已经完全坍塌，仅看到断墙残柱。明间和西边的两间屋面尚未完全倒塌，从而保留了大木屋架和瓦屋面做法的原始形制。从现场看，屋面系望砖上铺小青瓦屋面，现存局部轩廊则是椽上铺的望板，室内一片狼藉，坍塌掉落的木构、瓦件、青砖以及树叶随处可见，仅有西边两间露出少许水泥地坪。门窗均为后改样式，破损严重，木构件油漆脱落严重，外墙饰面层呈片状剥落，大部分已露出砖砌体，外墙檐口彩绘亦仅残存点点滴滴。此外，后檐墙东侧搭建了石棉瓦车棚等破败严重。

第三进藏经阁是二层楼房，五开间，平瓦屋面系后期更换，瓦面局部破损导致漏光见天。二层木地板不复存在，现场系后期修缮安装的纤维板吊顶，且因漏雨严重，部分掉落，透过吊顶洞口可见大木构架，大木构架基本完整，但部分木柱角糟朽严重。二层的栏杆保存基本完整，反应了当时的形制做法，门窗系后改，缺失严重，破败不堪。外墙饰面系后人粉刷，破坏了文物原状，木构油漆氧化严重。配房为平房，屋面几乎完全坍塌，前檐墙为红砖墙，基本安全，后檐墙破败不堪，残垣断壁，主要因年久失修，没有屋面的覆盖保护，长年裸露，无专人管护，构树等杂树就附生于墙体，树木长时间的生长和墙体及大木构浑然一体，近年夏季天气恶劣，台风过境时，树被刮倒，连带墙体和大木构被拉拽，导致墙体倒塌，柱贴歪斜。地面到处是建筑破损构件，门窗也都破败缺失，完全可以用面目全非来形容。
藏经楼东、西两侧后建房屋目前基本安全。东侧房屋共两间，借用藏经楼东山墙，后建一堵山墙，通过硬山搁檩搭建而成，中间有钢构三角架架在砖柱上，檩条为预制钢筋混凝土材料，屋面局部破损漏雨。西侧房屋现存四开间，块石砌筑的墙身下碱，青砖砌筑的墙身，与围墙连接的山墙是红砖砌筑的，木制三角架上搁檩、椽，覆盖彩钢瓦，个别地方漏光见天，水泥地面，门窗部分缺失，且个别洞口用红砖封堵，内墙面粉面陈旧剥落严重。此外西侧房屋与藏经楼过道处经覆盖彩钢瓦，红砖砌墙形成一个房间。东侧辅助用房为后建平房，一共六间，木结构体系，围护墙体。东边三间屋面坍塌严重，西边三间屋面局部漏雨，个别门窗洞口用红砖封堵，门窗破损缺失严重，且建筑西北角生有杂树，深植于墙体，因树木生长，已将墙体撑裂，后檐墙顶亦有一棵构树，胸径有375px，导致墙体开裂变形，这些都严重威胁文物建筑的安全。

既然实质上不保护，发那块文保碑干嘛