请教一下贴吧各位大佬，在lammps中怎么计算氢键的数量啊，
lammps吧
全部回复
仅看楼主
level 5
讉废了孤独
楼主
请教一下贴吧各位大佬，在lammps中怎么计算氢键的数量啊，或者是自己编程计算？有大佬做过吗，想请教一下
2019年07月01日 13点07分
1
level 5
于洛洛啊
我们这边有个LAMMPS课程学习，可以帮助到了，感兴趣可以q我
2019年07月22日 07点07分
2
level 9
林锐界cW
如何定义氢键呢
2019年07月22日 08点07分
3
讉废了孤独
根据供体受体原子距离和角度来定义
2019年07月23日 13点07分
林锐界cW
@讉废了孤独
那就写个ovito的Python
2019年07月23日 14点07分
level 3
明明的事😹
把轨迹导入vmd计算
2019年07月22日 09点07分
4
讉废了孤独
请问具体怎么操作呢
2019年07月23日 13点07分
明明的事😹
很简单啊 把轨迹或data文件倒入vmd找到氢键选项，指定粒子种类（比如水的氢原子和氧原子），指定角度和距离就ok啦，计算就可以了
2019年07月25日 14点07分
07250907TRM
@明明的事😹
大佬，为什么导入轨迹文件以后计算氢键什么也没输出呢
2019年10月13日 09点10分
明明的事😹
指定粒子种类了吗？一般用type 1 其中1代表氧原子的种类id，然后type 2 2代表氢原子种类id这样
2019年10月20日 11点10分
1
