海洋作为地球上最大的生物栖息地，其中，深海微生物资源是世界各国竞争最激烈的领域之一。在（微生物前沿）中有学者说深海微生物种类包括细菌、放线菌、真菌、酵母菌、病毒等，其中特殊的有古菌、与深海动物的共生菌、极端菌(嗜压、嗜碱、嗜酸、嗜盐、嗜冷、嗜热菌)等。在11km深的马里亚纳海沟，乃至太平洋海底沉积层的500m深处都发现了活细菌。在有记载36门生物中，有34门发现于海洋，呈现出了丰富的生物多样性。