制造型企业种类众多，但根据生产模式可以归结为两种：离散制造业与流程生产行业。MES作为信息化已经智能制造当中不可缺失的一环，对于这两方生产模式的行业应用，也有不同的差异。先从MES上级计划层与现场作业计划调动的应用说起。
1、上层ERP的不同与对MES的影响
MES系统处于企业的计划执行层，从ERP层接受计划指令，并向ERP反馈信息。无论流程生产行业还是离散制造行业，MES都要与ERP建立紧密的信息集成。因此，MES的应用应该首先了解对应两方面行业的ERP层有什么不同。
　　两者对于生产模型的要求不同——流程生产行业中体现了以配方为核心的生产模型，而离散行业中体现了以产品BOM为核心的生产模型。
生产计划方式方面，流程企业根据市场的需求进行生产的观念已经逐步加深，通过大批量生产，降低成本，提高竞争力。因此，作为流程企业生产计划的依据，主要是市场预测。离散企业一方面可以根据定单进行生产，另一方面也可以根据市场预测作为生产计划制订的依据。
离散企业的ERP系统向MES下达作业计划指令主要以“工作令”的方式，而流程企业的作业计划下达主要以指令计划形式方式。
2、车间现场作业计划调度
　　离散企业的生产作业计划调度，需要根据优先级、工作中心能力、设备能力、均衡生产等方面对工序级、设备级的作业计划进行调度。这种调度，是基于有限能力的调度并通过考虑生产中的交错、重叠和并行操作来准确地计算工序的开工时间、完工时间、准备时间、排队时间以及移动时间。通过良好的作业顺序，可以明显地提高生产效率。
流程企业的产品，是以流水生产线方式组织、连续的生产方式，只存在连续的工艺流程，不存在与离散企业对应的严格的工艺路线。因此，在作业计划调度方面，不需要也无法精确到工序级别，而是以整个流水生产线为单元进行调度。从作业计划的作用和实现上，比离散企业相对简单。