Lammps做CNT和生物分子的结合，data文件中二面角系数问题求教
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豹子头风雪一更 楼主
最近在Lammps中，做CNT和生物分子的结合，由于in文件中，生物分子dihedral_style用的是charmm，improper_style用的是harmonic力场，用Lammps生成的CNT所用力场确是harmonic和cvff力场，这个地方不知道该如何调整，有知道的大神，还望不吝赐教！！！
2018年07月02日 09点07分 1
level 9
林锐界cW
你CNT想用什么力场描述呢？
2018年07月02日 11点07分 2
豹子头风雪一更
CNT的dihedral_style用的是charmm，improper_style用的是harmonic力场，谢谢！！
2018年07月02日 12点07分
豹子头风雪一更
截图的是CNT相关参数现在的力场
2018年07月02日 12点07分
林锐界cW
@豹子头风雪一更 那就把这些都删了，直接在in文件里面定义力场参数不就好了
2018年07月02日 12点07分
豹子头风雪一更
刚才我也在考虑这个东西，但是，我第一次在lammps中做生物分子，data文件中原子类型有三四十种，如果考虑两两原子的相互作用，似乎有点难度，这个也是我目前遇到的困境，如果您方便，可以把您的qq留给我，想向您请教一下，自己一个人做这些东西没人讨论，很困难，如果，也可以加我qq：850293076
2018年07月02日 12点07分
level 5
豹子头风雪一更 楼主
2018年07月04日 13点07分 3
level 9
林锐界cW
回复 豹子头风雪一更 :你用的什么atom style？
2018年07月04日 13点07分 4
豹子头风雪一更
不知道怎么上传文件，就截了图，我用的是全原子力场
2018年07月04日 13点07分
林锐界cW
@豹子头风雪一更 把read_data放到那一堆style后面
2018年07月04日 13点07分
豹子头风雪一更
@林锐界cW 我把read_data放在improper_style的后面，又有新的报错
2018年07月04日 14点07分
林锐界cW
@豹子头风雪一更 那应该是别的问题吧
2018年07月04日 14点07分
level 5
豹子头风雪一更 楼主
全原子力场，这里不知道怎么上传文件，只能截图
2018年07月04日 13点07分 5
level 5
豹子头风雪一更 楼主
2018年07月04日 14点07分 6
林锐界cW
你Pair_style呢。。
2018年07月04日 14点07分
豹子头风雪一更
@林锐界cW 哦哦，pair_style没有定义，我加上试试
2018年07月04日 14点07分
豹子头风雪一更
pair_style在下面，pair_style hybrid lj/charmm/coul/long 8 10，我要的这个
2018年07月04日 14点07分
豹子头风雪一更
@林锐界cW 我改了文件之后，出现错误，求指教，我在回复里面上传了图片，谢谢！！
2018年07月05日 09点07分
level 5
豹子头风雪一更 楼主
2018年07月05日 09点07分 7
林锐界cW
少参数吧，你问得这些问题你看manuel都能解决
2018年07月05日 10点07分
豹子头风雪一更
@林锐界cW 好的。
2018年07月05日 10点07分
豹子头风雪一更
@林锐界cW 我参照这manuel解决到这一步，在之前pair_coeffs都已经定义过了，为什么这里还提示： All pair coeffs are not set
2018年07月05日 13点07分
林锐界cW
@豹子头风雪一更 你不是用pair_modify mix么，没记错应该是定义1-1 2-2 3-3 4-4 5-5 6-6... 35-35的coeff然后mix么，按照你这个写法，好多都没有顶一把，然后你的键键角二面角的参数都没有，肯定还得接着报错。。
2018年07月05日 13点07分
level 5
豹子头风雪一更 楼主
2018年07月05日 13点07分 8
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