还真没研究过

MyEclipse 中修改JSP模板
在X:\Program Files\MyEclipse 6.0\myeclipse\eclipse\plugins\com.genuitec.eclipse.wizards_6.0.1.zmyeclipse601200710\templates\jsp 目录下找到Jsp.vtl，复制一份，重命名为jsp2.vtl,然后把里面的内容修改为自己想要的格式，保存。
然后在 X:\Program Files\MyEclipse 6.0\myeclipse\eclipse\plugins\com.genuitec.eclipse.wizards_6.0.1.zmyeclipse601200710 目录下找到templates.xml，用文本编辑器打开。在
 <template
 context="com.genuitec.eclipse.wizards.jsp"
 script="templates/jsp/Jsp.vtl"
 name="Default JSP template"/>
下面增加
 <template
 context="com.genuitec.eclipse.wizards.jsp"
 script="templates/jsp/jsp2.vtl"
 name="JSP2 template"/>
保存。重启eclipse。
新建jsp，在模板中就会出现JSP2 template，选中，按完成，新建的jsp页面就按你的模板生成了！

大致就是在Window>Preferences>General>Workspace的Tex File Encoding面，时间过了这么久了，刚才我也在找，现在找到了，我改了能用，分享下。