尽管我可能是个百合豚，但作为一部人设、剧情、作画、音乐上都优秀的，有实力排进Anime of The Year的好番，绝不应该只有百合，因此我将会谈谈番里一些点，也算作为给一些没看懂的朋友们的解惑吧。

占住二楼，三楼开始。

首先，是这一切的起源
Pure Illusion到底是什么，众说纷纭，常言道“艺术来源于现实”，这番的大部分内容都能找到象征和映射，更不用说作为舞台的PI，但因为番里给出的解释太过玄乎所以我们并没能找到答案。
于是我打算另辟蹊径，还记得在异变的开头，年轻时的咪咪和帕皮卡娜发现了什么吗？没错，它的名字更有趣点：Elpis

Elpis，希腊语的“希望”。
在希腊神话里，普罗米修斯创造了人类，并希望给人类最好的生活，那里没有忧伤、病痛、苦难。但宙斯发现了人类并要求人类敬奉他，普罗米修斯为人类辩护时想欺骗宙斯，而宙斯识破了他的伎俩却装作被骗，以此为由做出惩罚：拿走了人类生存最需要的火。普罗米修斯没有放弃，他偷走了火让人类得以继续生存，结果很自然的触怒了宙斯。
宙斯决定报复：在惩罚普罗米修斯的同时，不借自己手折磨人类。他命众神创造了一个完美的女人：潘多拉，并嫁给伊皮米修斯——普罗米修斯的弟弟，并在婚礼时给新人们一个盒子，那里面有众神们的礼物。
潘多拉最大的特点，或者说缺点，就是好奇心。尽管伊皮米修斯一再的警告和提防，但还是被潘多拉打开了魔盒，里面的东西飞向了人间，仓促盖上盒子也无济于事，里面只剩下了“Elpis”，“希望”。

既然Elpis是那么美好的“希望”，那为什么会在这部番里以反派的形象出现呢？
我注意到了神话的另一个版本，盒子是被雅典娜出于善意盖上的，也就是说，有意关住了“Elpis”。
Elpis并没有那么简单，不是一个“希望”一个“Hope”能翻译的事。它代表的是“不切实际的期冀”，英国作家塞缪尔·约翰逊有句话：“The road to hell is paved with good intentions.”（通向地狱的道路，是由希望铺就的。），大抵能说明这个Elpis有多么可怕。一个人不切实际，违背现实的愿望，确实通常会带来灾难。而那些灾难的后果，远比潘多拉放出的其他东西要恐怖的多，足以毁灭人类。

看到这个，相信部分朋友已经意识到了，为什么可可娜和帕皮卡在第六集的PI里碰到Elpis会指引她们通向学姐的回忆。
对，因为那是学姐的“Elpis”，不切实际的期冀。她明明答应了老奶奶在忘了她的时候让她想起，却因为双亲的伤害、自己的脆弱抛弃了失忆的奶奶，抛弃了约定。她后悔着，并忏悔着：“指甲油啊，因为我不配涂那个。”，而且在心中有一份“Elpis”——如果我能在那时，让她回忆起我来，那该多好啊。
所以可可娜和帕皮卡看到了那份后悔，善良的她们决定帮助学姐完成她的心愿。
看上去很美好吧，学姐也因此打开了心结……
……可是，真的好吗？学姐不再情系过去，不再压抑自己，不再不涂指甲油，甚至……不再珍惜自己曾视作宝物的画。这样真的好吗？
可可娜发现了这个恐怖的事实，她们改变了现实世界。原理什么的不知道，是变更了世界线还是平行世界什么的都没关系，最重要的是，现在，她们改变了世界。
所以这里，一个貌似不起眼的支线，成为了本番的第二个转折点。

可可娜发现了，通过Elpis能改变世界。
这也就是为什么神秘组织——前身是以前索尔特工作过的研究院——那么努力的想揭开Elpis的秘密，因为有掌握Elpis的可能性，也就有能掌握世界的可能性。或许在以前，研究院单纯只是想探索PI的奥秘，像希达卡博士那样。但在发现Elpis后，索尔特的爸爸疯了以后，我们有理由相信研究已经变味了。
同时咪咪怀孕了，她自己已经无所谓，但她不想让孩子也一辈子都被困在这里，更何况这里已经因为有个疯子变得愈加危险。所以她要逃出去，于是就有了后面逃走—被抓—再度试图逃走的剧情。只不过第二次被抓到后，疯子打算惩罚咪咪，让她死了逃走的心，但也不能伤害她，毕竟还要靠她进入PI。还是婴儿的孩子自然就是好选择，咪咪被逼入了绝境，此时有“人”伸出了援手，不用我说大家也应该知道了。
这个“人”不是谁，就是咪咪自己。准确的来说，能进入PI的咪咪迫不得已选择了Elpis的力量，为了保护女儿她已经不惜一切。
顺带一提，在咪咪做出选择前的苹果大概是禁果的隐喻，而引诱亚当和夏娃吃下禁果的是蛇——代表原始的、鲁莽的欲望——所以在最终话里黑咪咪的象征才会是蛇。
然后就是剧情里的，Elpis化的咪咪，黑咪咪一个人几乎团灭了研究所，即将抱着女儿消失在光芒中，会怎么样呢，现实世界会不会毁灭？其实后果我也不知道，毕竟最后没发生。
帕皮卡娜冲过来试图挽留，咪咪在最后一刻才发现自己已经失去理智，并用仅剩的力量将女儿交给了帕皮卡娜，让她变回婴儿同时失忆，希望她能和自己的女儿重新开始，重新开始自由的人生。
而自己，估计已经消耗了太多，不过最后的愿望也算是完成了，便散成万千碎片撒落于世。
故事本该到这就结束。

辛苦了

接下来的事TV似乎没讲，但从后面的发展大概看得出来。研究所人员并未全部阵亡，剩下的人重建了一个组织，意图总有一天能控制Elpis，他们敬奉阿斯克勒皮俄斯的蛇，认为自己是将饱受潘多拉魔盒所泄之物折磨的人类拯救的医神，殊不知那却是古老的伊甸园毒蛇，而他们也只是被诱惑的凡人之一罢了。
重生的神秘组织先索尔特一步找到了可可娜，同时做了两层准备：
一、尽量集齐碎片复活咪咪（还在作死，好了伤疤忘了痛）；
二、如果咪咪复活不了，她女儿也应该有可能可以进入PI。
所以帮可可娜建造了一个“家”，一个假的奶奶和假的朋友——娅娅卡。让她能像正常人一样生活，但时刻都在组织的控制下。
……至于为什么不关起来，估计是怕咪咪的悲剧重现吧？
而索尔特，大概负责了抚养帕皮卡长大，同时为了抢夺碎片不让神秘组织复活咪咪，凑齐了技术人员，暗中寻找着女儿。（真不容易……岳父你真行_(:3」∠)_
就这样，一直到了故事正片发生的时候。

楼主分析地不错啊

拍学家

背景咱大概能推测出来，潘多拉魔盒欲望之类的，好多细节还是不懂啊尤其最后一集好跳啊，还不是之前的那种跳，直接把情节切开再也连不上的感觉

剩下的事情估计你们也知道了，咪咪还是被复活了，只不过是黑的。
那个黑咪咪，就只剩下最简单的欲望：
“我要保护我的女儿，不受任何东西的侵犯，所以人类也好世界也好，就这样全都变成我的Elpis里的样子吧”
于是世界开始畸形，而帕皮卡、娅娅卡和索尔特一众人，需要做的只有与那被蛇占领了的、被欲望蒙蔽了双眼的咪咪战斗，避免世界毁灭。
最后就是领悟了一个道理的可可娜和帕皮卡双双觉醒打败了黑咪咪，咪咪也让自己从过去选择错的道路中解脱了出来。可喜可贺可喜可贺（撒花
而最后一次的黑白世界，仿佛是最正常的。那里没有PI没有斗争，也（似乎）没有碎片，一切看起来都是正常的。
那像是一次提问，也可能是黑咪咪的最后一次挣扎，没有PI就可以吗？未来交给可可娜自己选择了。
可可娜牵着帕皮卡的手，勇敢的踏出那一步，如此响亮：“当然不可以！”
蝴蝶代表着灵魂，咪咪的灵魂引导着她们，回到了现实世界。

楼主说的很有道理嘛，赞一个

现在有答案了。
PI到底是什么？
我认为，大概就是潘多拉之盒。
黑咪咪在回答为什么要独占可可娜时说：“那个世界也许会有痛苦，也许会有悲伤，我不能把女儿留在那个世界里”
确实，潘多拉放出了痛苦、悲伤、灾祸、疾病等等诸如此类的东西。
但却不止那些，传闻说，还有爱情、友情和幸福。
要知道潘多拉，可是第一个人类女人。
黑咪咪的世界像是一个不切实际的梦，平静死寂，没有波澜没有色彩。
同样，一路平坦的生活没有意义，冒险前的可可娜没有一丝生气，因为死了也差不多吧，那活着有什么用？
而现实世界正因为有了潘多拉拿着魔盒泼洒出的颜色，才会如此生气盎然，精彩万分。
是的，有苦也有甜，有疼痛也有收获，这才是真正的人生。
而可可娜在两者之间，做出了选择。她想要的是精彩的人生，无论后果，无怨无悔。
顺带说句，潘多拉的女儿和女婿，在后来惩罚人类的大洪水中，只有他们两个活了下来。