level 3
看喷子就烦
楼主
S003:数据好不好,先看统计表。
有的时候解析不出来结果,往往是数据的问题。在这里介绍下衍射数据的一些统计值及常见报的错误。
典型的数据统计表如下表所示(Xprep里[D]->[S]->[A]选项给出的)。
INTENSITY STATISTICS FOR DATASET # 1 Z057m.hkl
Resolution #Data #Theory %Complete Redundancy Mean I Mean I/s R(int) R(sigma)
Inf - 2.30 317 319 99.4 6.65 438.5 45.10 0.0464 0.0177
2.30 - 1.80 315 315 100.0 7.71 246.4 38.57 0.0474 0.0209
1.80 - 1.55 333 333 100.0 7.68 186.9 30.44 0.0561 0.0263
1.55 - 1.40 318 318 100.0 7.36 100.0 19.68 0.0880 0.0429
1.40 - 1.25 490 490 100.0 6.82 74.2 13.99 0.1171 0.0613
1.25 - 1.15 473 473 100.0 6.28 68.4 11.12 0.1288 0.0737
1.15 - 1.10 314 314 100.0 5.94 50.2 8.54 0.1648 0.0986
1.10 - 1.05 342 342 100.0 5.73 45.7 7.67 0.1829 0.1103
1.05 - 1.00 457 457 100.0 5.50 38.8 6.44 0.2063 0.1321
1.00 - 0.95 530 530 100.0 5.21 34.4 5.55 0.2396 0.1564
0.95 - 0.90 662 662 100.0 4.97 24.1 4.07 0.3180 0.2205
0.90 - 0.85 822 822 100.0 4.67 17.9 2.94 0.4404 0.3081
0.85 - 0.81 800 809 98.9 4.31 13.5 2.22 0.6067 0.4279
------------------------------------------------------------------------------
0.90 - 0.81 1622 1631 99.4 4.49 15.7 2.58 0.5084 0.3587
Inf - 0.81 6173 6184 99.8 5.74 79.1 11.83 0.1018 0.0673
Merged [A], lowest resolution = 13.71 Angstroms, 1278 outliers downweighted
表中比较重要的统计量有 Resolution(分辨率),%Complete(完整度), Redundancy(冗余度) Mean I(平均衍射强度), Mean I/s(平均信噪比), R(int)(衍射强度误差), R(sigma) (平均噪音)。
一般来说,分辨率数值过大,报错。铜靶最起码要到0.84,报错只能重新收数据。(不过一般仪器都会自动收到相应分辨率,不用操心。)
完整度低,报错,该数值越接近百分之百越好。报错的话,如果分辨率数值够小可以适当切掉一些高角度的点提高完整度。如果差太多只能重新收。
冗余度,checkcif一般不会检查这个选项,但是冗余度过低可能导致Rint高,定绝对构型的话最好有较高冗余度。
平均衍射强度和平均信噪比如果数值过低,如分辨率1.8以下平均衍射强度只有0.几,可能报错“可观测衍射点少”,只能换个大些的晶体重新收数据。
Rint数值过大,大于0.12会报错,如果没做吸收校正最好先做吸收校正,校正完后还是高只能换个大点好点的晶体重新收数据了。
Rsigma不会检查,但是最好也别过大,过大可能会导致出现某些无法解释的峰。
总之,拿到数据先看看好不好,好的数据是好的解析结果的先决条件。
2016年06月12日 13点06分
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有的时候解析不出来结果,往往是数据的问题。在这里介绍下衍射数据的一些统计值及常见报的错误。
典型的数据统计表如下表所示(Xprep里[D]->[S]->[A]选项给出的)。
INTENSITY STATISTICS FOR DATASET # 1 Z057m.hkl
Resolution #Data #Theory %Complete Redundancy Mean I Mean I/s R(int) R(sigma)
Inf - 2.30 317 319 99.4 6.65 438.5 45.10 0.0464 0.0177
2.30 - 1.80 315 315 100.0 7.71 246.4 38.57 0.0474 0.0209
1.80 - 1.55 333 333 100.0 7.68 186.9 30.44 0.0561 0.0263
1.55 - 1.40 318 318 100.0 7.36 100.0 19.68 0.0880 0.0429
1.40 - 1.25 490 490 100.0 6.82 74.2 13.99 0.1171 0.0613
1.25 - 1.15 473 473 100.0 6.28 68.4 11.12 0.1288 0.0737
1.15 - 1.10 314 314 100.0 5.94 50.2 8.54 0.1648 0.0986
1.10 - 1.05 342 342 100.0 5.73 45.7 7.67 0.1829 0.1103
1.05 - 1.00 457 457 100.0 5.50 38.8 6.44 0.2063 0.1321
1.00 - 0.95 530 530 100.0 5.21 34.4 5.55 0.2396 0.1564
0.95 - 0.90 662 662 100.0 4.97 24.1 4.07 0.3180 0.2205
0.90 - 0.85 822 822 100.0 4.67 17.9 2.94 0.4404 0.3081
0.85 - 0.81 800 809 98.9 4.31 13.5 2.22 0.6067 0.4279
------------------------------------------------------------------------------
0.90 - 0.81 1622 1631 99.4 4.49 15.7 2.58 0.5084 0.3587
Inf - 0.81 6173 6184 99.8 5.74 79.1 11.83 0.1018 0.0673
Merged [A], lowest resolution = 13.71 Angstroms, 1278 outliers downweighted
表中比较重要的统计量有 Resolution(分辨率),%Complete(完整度), Redundancy(冗余度) Mean I(平均衍射强度), Mean I/s(平均信噪比), R(int)(衍射强度误差), R(sigma) (平均噪音)。
一般来说,分辨率数值过大,报错。铜靶最起码要到0.84,报错只能重新收数据。(不过一般仪器都会自动收到相应分辨率,不用操心。)
完整度低,报错,该数值越接近百分之百越好。报错的话,如果分辨率数值够小可以适当切掉一些高角度的点提高完整度。如果差太多只能重新收。
冗余度,checkcif一般不会检查这个选项,但是冗余度过低可能导致Rint高,定绝对构型的话最好有较高冗余度。
平均衍射强度和平均信噪比如果数值过低,如分辨率1.8以下平均衍射强度只有0.几,可能报错“可观测衍射点少”,只能换个大些的晶体重新收数据。
Rint数值过大,大于0.12会报错,如果没做吸收校正最好先做吸收校正,校正完后还是高只能换个大点好点的晶体重新收数据了。
Rsigma不会检查,但是最好也别过大,过大可能会导致出现某些无法解释的峰。
总之,拿到数据先看看好不好,好的数据是好的解析结果的先决条件。