2013
弗拉门戈2013年6月，巴甲弗拉门戈队战绩不佳，主教练被解雇，梅内塞斯成为弗拉门戈新主教练。 9月19日，球队依然在为保级挣扎的时候，他主动从弗拉门戈辞职。在弗拉门戈短暂的执教时间中，梅内塞斯带队在巴甲16场比赛5胜6平5负。
2014
科林蒂安2013年12月11日，曼诺·梅内塞斯重返科林蒂安，俱乐部在上赛季未能取得好的成绩，列积分榜中游。梅内塞斯在科林蒂安期间实现了一批球员的更新换代，清理了保罗安德烈，迭戈·马塞，艾默生谢赫等一批球员。最终，科林蒂安在2014年巴甲排名第四，获得第二年南美解放者杯资格。赛季结束，梅内塞斯宣布不再续约。