问题1这个计时器譬如我输入3500s，那应该是00.59.20，但是它倒计时的时候只是倒计时最后一个秒。直接就是20了，然后就停止了，我实在是搞不出来了。如何让他倒计时，可以输入3600s然后可以倒计时成00.59.59.想这个样子倒计时1个小时这样，我知道是哪个地方有问题，但是我不会解决，有经验的帮我看看。我在图里面表出来了。
问题2停止之后会一直跳出msgbox，一直跳一直跳，看图
问题3停止之后，在进行设置的下一次倒计时，我的按钮，没有自动转换成开始，而是还是停止。看图

主要问题是出在这个Calltime上面，你的Inputtime被覆值了，就是MOD这里， 这里你可以这样修改
Dim T As DateTime = DateTime.Now.Date & " 00:00:00"
T = T.AddSeconds(Inputtime)
showtimeText = T.ToString.Replace(DateTime.Now.Date, "")

还有一点Timer控件的Enabled，Start，Stop建议用一种，不要混着用，容易弄乱了。
Enabled=False就是Start
Enabled=True 就是Stop

你的代码写得太臃肿了。