特别是最主要的问题，为什么要这么设置地堡？根本没做解释。

你真看完了？

已经解释很清了：大清洗。
出版商介绍说，是瑟曼几个政客为了自己的永生而不惜清洗掉人类。但是看完全书，并不支持这个观点。
我认为是瑟曼等人认为人类的文明已到了自我毁灭的边缘，大清洗不是为了清洗掉人类，而是为了清洗掉人类文明中的一些内容（除《遗赠》中罗列的之外）。《星移记》结尾已经昭示，最终包括1号地堡在内都要被按下按钮关闭，只剩下电脑选择的一个优胜地堡存活。当然这是计划，实际上生生不息、顽强的人类最终终止了这个计划。
可以说瑟曼等人是对人类终极命运有思考的、但是自负且刚愎的一夥人，并不是寻常意义上的反派角色。小说男女主角们当然充满着人性的光辉，但是瑟曼等人对人类的终极慈悲也算是个悲剧。

瑟曼等人毁灭人类文明中的暴力（目前姑且假定）部分这个设定，和奥斯特 卡德的《回家》系列、《搜影者》系列的设定类似，都是假定人类未来失去了昔日的文明，且都是为了人类的和平发展而有意为之的。不同的是《羊毛战记》系列描写的是这一计划的开始阶段，并且被人为终止了计划的实施。
卡德上述两个系列小说都是借助于未来人类的高科技（《回家》系列是计算机超灵，《搜影者》是机器人）照看被剥夺了文明的人类，且都是发生在外星球上。《羊毛》系列则是发生在地球上。小说开篇就写到，跨越时间什么的。卡德的小说是跨越空间（外星移民），休 豪伊则是选择了跨越时间（计划原定是500年，实际延续了约300年被终止）。好在休最新的《异星记》也把眼光投在了外星上。
不由想到了大刘的《微观世纪》，科幻小说一般写大，而大刘反其道去写小。休和卡德之比类似。