楼主这么问其实是因为重装系统后也遇到这种情况，找到一些文章（不过是好几年前的），跟大家分享下。
先说下我的暴力方法，直接在注册表[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run]下新建可扩充字符串值，修改数值数据为软件的地址，我只是根据RUN下的其他软件有样学样啦，不知道真正等出问题时，是否能用。【注：我为win10系统】图示如下：
打开注册表win+R输入regedit
找到位置新建可扩充字符串值
桌面COMODO右键属性，找到COMODO软件地址，注意取目标的前面这一截
右键刚新建的可扩充字符串值，修改复制到数值数据，数值名称随便
重启，成功！
【须知】本帖系本人所分享的一些小技巧，不值得但不拒绝非恶性转载，转载须注明转载来源及作者，尊重作者的劳动，谢谢。

靠，机器把帖子封了3天，下面放搜到的方法。

上面的方法仅适用于在注册表下RUN中没有COMODO的字符串值，下面是以前别人的方法（转载于卡饭论坛）：【更新】关于毛豆COMODO托盘图标开机不显示的解决办法【图文分析供参考】
bbs.kafan.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=1243427&highlight=%CD%BC%B1%EA
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没人

没办法，这软件太复杂，我已经放弃了

没人

才发现我们吧竟然没有吧主