在某些情况下，若要将主分区转换为逻辑分区，或要将逻辑分区转换为主分区，可利用DiskGenius实现。由于MBR分区表格式的限制，最多只能有四个主分区并且最多只能有一个扩展分区。因此在逻辑分区与主分区之间进行转换是有一定限制的。
要将主分区转换为逻辑分区，必须同时满足下列条件：
1、主分区之前存在转换到逻辑分区需要的空闲扇区(一般为一个磁道，比如63个扇区。最少需要一个扇区)。
2、当前磁盘上没有扩展分区，或者要转换的主分区紧邻扩展分区。
要将逻辑分区转换为主分区，则要同时满足下列条件：
1、转换后当前磁盘的主分区数目不多于四个(含当前磁盘只有一个逻辑分区的情况)。
2、要转换的逻辑分区位于扩展分区的两头。
当分区满足上述的转换条件时，相应的菜单项才会有效。否则显示为灰色。