首先要感谢以下几位大神的分析，其实楼主刚看完动画还真是没搞明白的，看了你们的观点基本就顺了。
@Ave_R @底线1004 @11十二月十二 @凉风沙沙 @Tades4
然后问题来了。大方向上大家理解的基本一致：
青叶：高中无记忆——穿越，轮回，结局返回——大学带记忆撞人——实验把雏穿越了
雏：大学无记忆撞人——研究时穿越，轮回，结局返回
这样是最happy的end了，但过程中存在许多剧情没来得及解释漏洞
下面是所有传送：
1，2084年联合军雏与比森卷入——2014联合军雏与比森传来
2，2014联合军雏、青叶卷入——2084青叶传来，之前10岁失忆雏已经来到
3，2084佐基利亚雏与比森卷入——2014佐基利亚雏与比森传来
4，2014佐基利亚雏、青叶卷入——2084青叶传来，之前10岁失忆雏已经来到
5，实验雏穿越——2084无记忆雏传来
6，2084比森被击坠后卷入——2014无机体比森传来
7，2084结局雏与青叶返回——实验雏返回，高中青叶返回
雏的逻辑路线基本是完美的：普通人成长，大学撞人认识青叶——传送5——传送1——传送2——（传送4——传送3）轮回N次——传送4——轮回打破，传送6，然后结局传送7。
he路线的青叶：普通人到高中，遇到传送3——传送4——打破轮回，传送6，结局传送7，大学去认识最初的雏帮她完成穿越经历
其他路线的青叶：普通人到高中，遇到传送3（有一次是1）——传送4，没能触发传送6
我觉得剧情逻辑是以雏为主视点的，其他路线的青叶悲剧地留在2084，和基友幸福快乐地生活在一起了
若硬要把多路线青叶融合也可行，剧情没怎么提，但可以脑补青叶被迪奥阻挡了下飞慢了没能击坠比森，但还是跟雏、比森一起穿回了2014，只是进洞晚了机体没了记忆也没了回去继续日常生活还跟雏重复了穿越轮回
只是觉得后者有点牵强，仁者见仁智者见智吧

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