apache上面可以跑java程序吗？或者python可以吗？
我试着传了一个java程序到服务器上面，打开URL就直接下载了
难道真的不行吗？

如果是用 CGI 的方式，用任何程序都可以跑；
用apache CGI 去搜一下，许多是用 shell 或 perl 程度来跑 CGI；
同理可用 java, python 以CGI的方式来跑。
然而，这效能速度不是那麼好。
就 python 而言，可以用 mod_python 的模块，在apache里跑python。
虽然没有 mod_java 这模块，
但常见的是在 tomcat 跑 JSP,
而 tomcat 本身就可以当 web 服务器，
不需跑 apache 的 httpd 服务。
如果类似像 tomcat 之类的环境有：
http://resources.coreservlets.com/jsp-servers.html
当然也可以跑各家的 Application 当后端，
而前端来跑 apache 的 httpd 或 nginx。