氨基酸（amino acids）: 　　是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物，氨基一般连接在α-碳上。氨基酸是肽和蛋白质的构件分子。 　 必需氨基酸（essential amino acids）： 　　指人（或其它脊椎动物）自己不能合成，需要从饮食中获得的氨基酸，例如赖氨酸、苏氨酸等氨基酸。 　 非必需氨基酸（nonessential amino acids）：　 　　指人（或其它脊椎动物）自己能由简单的前体合成的，不需要由饮食供给的氨基酸，例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。 　 等电点（pI，isoelectric point）： 　　使分子处于兼性分子状态，在电场中不迁移（分子的净电荷为零）的pH值。 　 茚三酮反应（ninhydrin reaction）： 　　在加热条件下，氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色（与脯氨酸反应生成#）化合物的反应。 　 肽键（peptide bond）： 　　一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基缩合，除去一分子水形成的酰胺键。 　 肽（peptides）： 　　两个或两个以上氨基酸通过肽键共价连接形成的聚合物。 　 蛋白质一级结构(primary structure)： 　　指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序。 　 层析(chromatography)： 　　按照在移动相（可以是气体或液体）和固定相（可以是液体或固体）之间的分配比例将混合成分分开的技术。 　 离子交换层析(ion-exchange column chromatography)： 　　使用带有固定的带电基团的聚合树脂或凝胶层析柱分离离子化合物的层析方法。 　 透析（dialysis）： 　　通过小分子经半透膜扩散到水（或缓冲液）的原理将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。 　 凝胶过滤层析(gel filtration chromatography)： 　　也叫做分子排阻层析（molecular-exclusion chromatography）。一种利用带孔凝胶珠作基质，按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。 　 亲和层析（affinity chromatography）： 　　利用共价连接有特异配体的层析介质分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白或其它分子的层析技术。 　 高压液相层析（HPLC，high-pressure liquid chromatography）： 　　使用颗粒极细的介质，在高压下分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。 　 凝胶电泳（gel electrophoresis）： 　　以凝胶为介质，在电场作用下分离蛋白质或核酸等分子的分离纯化技术。 　 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳： 　　（SDS-PAGE，sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrohoresis） 　　在有去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰胺凝胶电泳。SDS-PAGE只是按照分子大小分离的，而不是根据分子所带的电荷和大小分离的。 　 等电聚焦电泳（IFE，isoelectric focusing electrophoresis）： 　　利用特殊的一种缓冲液（两性电解质）在聚丙烯酰胺凝胶内制造一个pH梯度，电泳时每种蛋白质就将迁移到它的等电点（pI）处，即梯度中的某一pH时，就不再带有净的正或负电荷了。 　 双向电泳（two-dimensional electrophoresis）： 　　是等电聚焦电泳和SDS-PAGE的组合，即先进行等电聚焦电泳（按照pI分离），然后再进行SDS-PAGE（按照分子大小），经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。 　 Edman降解(Edman degradation)： 　　从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修饰，然后从多肽链上切下修饰的残基，再经层析鉴定，余下的多肽链（少了一个残基）被回收再进行下一轮降解循环。 　 同源蛋白质（homologous proteins）: 　　来自不同种类生物、而序列和功能类似的蛋白质。例如血红蛋白。 构型（configuration）： 　　一个有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。这种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构型的改变往往使分子的光学活性发生变化。 

　脂溶性维生素（lipid vitamins）： 　　由长的碳氢链或稠环组成的聚戊二烯化合物。脂溶性维生素包括维生素A、D、E和K，这类维生素能被动物贮存。 　 　辅酶（coenzyme）： 　　某些酶在发挥催化作用时所需要的一类辅助因子，其成分中往往含有维生素。 　 　辅基(prosthetic group)： 　　是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物，用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。 　 　尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 　　（NADP＋，nicotinamide adenine dinucleotide phosphate）： 　　含有尼克酰胺的辅酶，在某些氧化还原反应中起着氢原子和电子载体的作用，常常作为脱氢酶的辅酶。 　 　黄素单核苷酸（FMN, flavin mononucleotide）： 　　核黄素磷酸，是某些氧化还原酶的辅酶。 　 　黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD, flavin adenine dinucleotide）： 　　是某些氧化还原酶的辅酶，含有核黄素。 　 　硫胺素焦磷酸（thiamine pyrophosphate）：是维生素B1的辅酶形式，参与转醛基反应。 　 　磷酸吡哆醛（pyidoxal phosphate）： 　　是维生素B6（吡哆醇）的衍生物，是转氨酶、脱羧酶和消旋酶的辅酶。 　 　生物素（biotin）：参与脱羧反应的一种酶的辅助因子。 　 　辅酶A（coenzyme A）：一种含有泛酸的辅酶，在某些酶促反应中作为酰基的载体。 　 　类胡萝卜素（carotenoids）:由异戊二烯组成的脂溶性光合色素。 　 　转氨酶（transaminases）： 　　也称之氨基转移酶（aminotransferases），在该酶的催化下一个α-氨基酸的氨基转可移给另一个α-酮酸。 醛糖（aldoses）：一类单糖，该单糖中氧化数最高的碳原子（指定为C-1）是个醛基。 　 　酮糖（ketoses）：一类单糖，该单糖中氧化数最高的碳原子（指定为C-2）是个酮基。 　 　异头物（anomers）: 　　仅在氧化数最高的碳原子（异头碳）具有不同构型的糖分子的两种异构体。 　 　异头碳（anomeric carbon）： 　　一个环化单糖的氧化数最高的碳原子。异头碳具有一个羰基的化学反应性。 　 　变旋（mutarotation）: 　　一个吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴随着它们的α-和β-异构形式的平衡而发生的比旋度变化。 　 　单糖（monosaccharide）：由三个或更多碳原子组成的具有经验公式（CH2O）n的简单糖。 　 　糖苷(glycosides)： 　　单糖半缩醛羟基与另一个分子（例如醇、糖、嘌呤或嘧啶）的羟基、胺基或巯基缩合形成的含糖衍生物。 　 　糖苷键(glycosidic bond)： 　　一个糖半缩醛羟基与另一个分子（例如醇、糖、嘌呤或嘧啶）的羟基、胺基或巯基之间缩合形成的缩醛或缩酮键，常见的糖苷键有O-糖苷键和N-糖苷键。 　 　寡糖（oligoccharide）：由2个～20个单糖残基通过糖苷键连接形成的聚合物。 　 　多糖（polysaccharide）： 20个以上的单糖通过糖苷键连接形成的聚合物。多糖链可以是线性的或带有分支的。 　 　还原糖（reducing sugar）： 　　羰基碳（异头碳）没有参与形成糖苷键，因此可被氧化充当还原剂的糖。 　 　淀粉（starch）： 　　一类可作为植物中贮存多糖的葡萄糖残基的同聚物。由两种形式的淀粉：一种是直链淀粉，是没有分支的只是通过α-（1→4）糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物。另一种是支链淀粉，是含有分支的α-（1→4）糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物，支链在分支点处通过α-（1→6）糖苷键与主链相连。 　 　糖原（glycogen）： 　　是含有分支的α-（1→4）糖苷键连接在一起的葡萄糖的同聚物，支链在分支点处通过α-（1→6）糖苷键与主链相连。 　 　极限糊精（limit dexitrin）: 　　是指支链淀粉中带有支链的核心部分，该部分在支链淀粉经淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的进一步降解需要α（1→6）糖苷键的水解。 

　 　肽聚糖（peptidoglycan）： 　　N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替连接的杂多糖与不同组成的肽交叉连接形成的大分子。肽聚糖是许多细菌细胞壁的主要成分。 　 　糖蛋白（glycoprotein）：含有共价连接的葡萄糖残基的蛋白质。 　 　蛋白聚糖（proteoglycans）： 　　由杂多糖与一个多肽链组成的杂化的大分子，多糖是分子的主要成分。 脂肪酸（fatty acid）： 　　是指一端含有一个羧基的长的脂肪族碳氢链。脂肪酸是最简单的一种脂，它是许多更复杂的脂（例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蜡）的成分。 　 　饱和脂肪酸（saturated fatty acid）：不含有-C＝C-双键的脂肪酸。 　 　不饱和脂肪酸（unsaturated fatty acid）：至少含有一个-C＝C-双键的脂肪酸。 　 　必需脂肪酸（ossential fatty acids）： 　　维持哺乳动物正常生长所需的，而动物又不能合成的脂肪酸，例如亚油酸和亚麻酸。 　 　三脂酰甘油（triacylglycerol）： 　　也称之甘油三酯（triglyceride）。一种含有与甘油酯化的3个脂酰基的脂。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。 　 　磷脂（phospholipid）：含有磷酸成分的脂。例如卵磷脂、脑磷脂等。 　 　鞘脂（sphingolipids）： 　　一类含有鞘氨醇骨架的两性脂，一端连接着一个长链的脂肪酸，了一端为一个极性的醇。鞘脂包括鞘磷脂、脑磷脂以及神经节苷脂，一般存在于植物和动物膜内，尤其是在中枢神经系统的组织内含量丰富。 　 　鞘磷脂（sphingomyelin）： 　　一种由神经酰胺的C-1羟基上连接了磷酸胆碱（或磷酸乙醇胺）构成的鞘脂。鞘磷脂存在于大多数哺乳动物细胞的质膜内，是髓鞘的主要成分。 　 　卵磷脂（lecithin）： 　　就是磷脂酰胆碱（PC，phosphatidyl choline），是磷脂酸与胆碱形成的酯。 　 　脑磷脂（cephalin）： 　　就是磷脂酰乙醇胺（PE，phosphatidyl ethanolamine）,是磷脂酸与乙醇胺形成的酯。 　 　脂质体（liposome）：是由包围水相空间的磷脂双层形成的囊泡（小泡）。 　 　生物膜（bioligical membrane）: 　　镶嵌有蛋白质的脂双层，起着划分和分隔细胞和细胞器的作用。生物膜也是许多与能量转化和细胞内通讯有关的重要部位。 　 　内在膜蛋白（integral membrane proteins）： 　　插入脂双层的疏水核和完全跨越脂双层的膜蛋白。 　 　外周膜蛋白（peripheral membrane proteins）： 　　通过与膜脂的极性头部或内在膜蛋白的离子相互作用和形成氢键与膜的内、外表面弱结合的膜蛋白。膜蛋白一旦从膜上释放出来，通常都是水溶性的。 　 　流体镶嵌模型(fluid mosaic model)： 　　针对生物膜的结构提出的一种模型。在这个模型中，生物膜被描述成镶嵌有蛋白质的流体脂双层，脂双层在结构和功能上都表现出不对称性。有的蛋白质"镶"在脂双层表面，有的则部分或全部嵌入其内部，有的则横跨整个膜。另外脂和膜蛋白都可以进行横向扩散。 　 　通透系数（permeability coefficient）: 　　是离子或小分子扩散过脂双层膜能力的一种量度。 　 　通道蛋白（channel proteins）: 　　是一种带有中央水相通道的内在膜蛋白，它可以使大小合适的离子和分子从膜的任一方向穿过膜。 　 　（膜）孔蛋白（pore proteins）:其含义与通道蛋白类似，只是该术语常用于细菌。 　 　被动转运（passive transport）： 　　也称之易化扩散（facilitated diffusion）。是一种转运方式，通过该方式溶质特异结合于一个转运蛋白，然后被转运过膜，但转运是沿着浓度梯度下降方向进行，所以被动转运不需要能量支持。 　 　主动转运（active transport）: 　　一种转运方式，通过该方式溶质特异结合于一个转运蛋白，然后被转运过膜，但与被动转运方式相反转运是逆着浓度梯度方向进行的，所以主动转运需要能量来驱动。在原发主动转运过程中，能源可以是光、ATP或电子传递。而第二级主动转运是在离子浓度梯度驱动下进行的。 

　 　拓扑异构酶（topoisomerase）: 　　通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键，然后重新缠绕和封口来改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶I通过切断DNA中的一条链减少负超螺旋，增加一个连环数；而拓扑异构酶II切断DNA的两条链增加负超螺旋，减少2 个连环数。某些拓扑异构酶II也称之DNA促旋酶。 　 　核小体（nucleosome）：用于包装染色质的结构单位，是由DNA链绕一个组蛋白核缠绕构成的。 　 　染色质(chromatin)： 　　是存在于真核生物间期细胞核内，易被碱性染料着色的一种无定形物质。染色质中含有作为骨架的完整的双链DNA，以及组蛋白、非组蛋白和少量的RNA。 　 　染色体(chromosome)： 　　是染色质在细胞分裂过程中经过紧密缠绕、折叠、凝缩和精细包装形成的具有固定形态的遗传物质存在形式。简言之，染色体是一个大的单一的双链DNA分子与相关蛋白质组成的复合物，DNA中含有许多基因，贮存和传递遗传信息。 　 　DNA变性(DNA denaturation)：DNA双链解链分离成两条单链的现象。 　 　退火（annealing）: 　　即DNA由单链复性变成双链结构的过程。来源相同的DNA单链经退火后完全恢复双链结构，同源DNA之间、DNA和RNA之间退火后形成杂交分子。 　 　融解温度(melting temperature, Tm)： 　　双链DNA融解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。 　 　增色效应（hyperchromic effect）： 　　当双螺旋DNA融解（解链）时，260nm处紫外吸收增加的现象。 　 　减色效应（hypochromic effect）：随着核酸复性，紫外吸收降低的现象。 　 　核酸内切酶(endonuclease)： 　　核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核酸分子内磷酸二酯键的酶。 　 　核酸外切酶(exonuclease)：从核酸链的一端逐个水解下核苷酸的酶。 　 　限制性内切酶（restriction endonucleases）: 　　一种在特殊核苷酸序列处水解双链DNA的内切酶。I型限制性内切酶既催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而II型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。 　 　限制酶图谱(restriction map)： 　　同一DNA用不同的限制酶进行切割从而获得各种限制酶的切割位点，由此建立的位点图谱有助于对DNA的结构进行分析。 　 　反向重复序列 (inverted repeat sequence)： 　　在同一多核苷酸链内的相反方向上存在的重复的核苷酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。 　 　重组DNA技术（recombination DNA technology）: 　　也称之基因工程(genomic engineering)。利用限制性内切酶和载体，按照预先设计的要求，将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转人另一生物细胞中进行复制、转录和表达的技术。 　 　基因（gene）: 　　也称之顺反子（cistron）。泛指被转录的一个DNA片段。在某些情况下，基因常用来指编码一个功能蛋白或RNA分子的DNA片段。 分解代谢反应（catabolic reaction）: 　　降解复杂分子为生物体提供小的构件分子和能量的代谢反应。 　 　合成代谢反应（anabolic reaction）： 　　合成用于细胞维持和生长所需要的分子的代谢反应。 　 　反馈抑制（feedback inhibition）： 　　催化一个代谢途径中前面反应的酶受到同一途径的终产物抑制的现象。 　 　前馈激活（feed-forward activation）： 　　代谢途径中一个酶被该途径中前面产生的代谢物激活的现象。 　 　标准自由能变化（ΔG°）（standard free-energy change）: 　　在一系列标准条件（温度：298K；压力：1个大气压；所有溶质的浓度都是1M）下发生的反应的自由能变化。ΔG°ˊ表示pH7.0条件下的标准自由能变化。 　 　标准还原电位（E°ˊ） 　　（standard reduction potential）： 　　25℃和pH7.0条件下一个还原剂和它的氧化形式在1M浓度下表现出的电动势。 

　酵解(glycolysis)： 　　一个由10步酶促反应组成的糖分解代谢途径，通过该途径，一分子葡萄糖转换为两分子丙酮酸，同时净生成两分子ATP和两分子NADH。 　 　发酵(fermentation)： 　　营养分子（例如葡萄糖）产能的厌氧降解，在乙醇发酵中，丙酮酸转化为乙醇和CO2。 　 　巴斯德效应(Pasteur effect)：氧存在下，酵解速度放慢的现象。 　 　底物水平磷酸化(substrate phosphorylation)： 　　ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的。这种磷酸化与电子传递链无关。 　 　柠檬酸循环（citric acid cycle）: 　　也称之三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle)，Krebs 循环（Krebs cycle）。是用于乙酰CoA中的乙酰基氧化生成CO2的酶促反应的循环系统，该循环的第一步反应是由乙酰CoA和草酰乙酸缩合形成柠檬酸。 　 　回补反应（anaplerotic reaction）： 　　酶催化的补充柠檬酸循环中间代谢物的供给的反应，例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反应。 乙醛酸循环（glyoxylate cycle）: 　　是某些植物、细菌和酵母中柠檬酸循环的修改形式，通过该循环可以由乙酰CoA经草酰乙酸净生成葡萄糖。乙醛酸循环绕过了柠檬酸循环中生成两个CO2的步骤。 戊糖磷酸途径（pentose phosphate pathway）： 　　也称之磷酸己糖支路（hexose monophosphate shunt）。是一个葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。该途径包括氧化和非氧化两个阶段，在氧化阶段，葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成两分子的NADPH；在非氧化阶段，核酮糖-5-磷酸异构化生成核糖-5-磷酸或转化为酵解中的两个中间代谢物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。 　 　糖醛酸途径(glucuronate pathway)： 　　从葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸开始，经UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗坏血酸的途径。但只有在植物和那些可以合成抗坏血酸（维生素C）动物体内，通过该途径可以合成维生素C。 　 　无效循环（futile cycle）： 　　也称之底物循环（substrate cycle）。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如，葡萄糖＋ATP＝葡萄糖-6-磷酸＋ADP与葡萄糖-6-磷酸＋H2O＝葡萄糖＋Pi反应组成的循环反应，其净反应实际上是ATP＋H2O＝ADP＋Pi。 　 　磷酸解（作用）（phosphorolysis）: 　　在分子内通过引入一个无机磷酸形成磷酸酯键而使原来键断裂的方式。实际上引入了一个磷酰基。 　 　半乳糖血症（galactosemia）: 　　人类的一种基因型遗传代谢缺陷，特点是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰转移酶导致婴儿不能代谢奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。 　 　尾部生长（tailward growth）: 　　一种聚合反应机理，经过活化的单体的头部结到聚合物的尾部，连接到聚合物尾部的单体的尾部又成了接收下一个单体的受体。 　 　糖异生作用(gluconeogenesis)： 　　由简单的非糖前体转变为糖的过程。糖异生不是糖酵解的简单逆转。虽然由丙酮酸开始的糖异生利用了糖酵解中的7步近似平衡反应的逆反应，但还必须利用另外4步酵解中不曾出现的酶促反应绕过酵解中的三个不可逆反应。 呼吸电子传递链（respiratory electron-transport chain）： 　　由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成，可将来自还原型辅酶或底物的电子传递给有氧代谢的最终电子受体分子氧（O2）。 　 　氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)： 　　电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶联的过程。 　 　化学渗透理论(chemiosmotic theory)： 　　一种学说，主要论点是底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动由ADP和Pi形成ATP的能量。 　 　解偶联剂（uncoupling agent）: 

　　一种使电子传递与ADP磷酸化之间的紧密偶联关系解除的化合物，例如2,4-二硝基苯酚。 　 　P/O比(P/O ratio)： 　　在氧化磷酸化中，每1/2O2被还原时形成的ATP的摩尔数。电子从NADH传递给O2时，P/O比为3，而电子从FADH2传递给O2时，P/O比为2。 　高能化合物(high energy compound)： 　　在标准条件下水解时自由能大幅度减少的化合物。一般是指水解释放的能量能驱动ADP磷酸化合成ATP的化合物。 叶绿体（chloroplast）：藻类和植物中含有叶绿素进行光合作用的器官。 　 　叶绿素（chlorophyll）： 　　光合作用膜中的绿色色素，它是光合生物中主要的捕获光的成分。 　 　辅助色素（accessory pigments）: 　　在植物和光合细菌中象类胡萝卜素、叶黄素和藻胆（色）素那样吸收可见光的色素，这类色素是对叶绿素捕获光能的补充。 　 　光合作用(photosynthesis)：绿色植物或光合细菌利用光能将CO2转化成有机化合物的过程。 　 　光合磷酸化(photophosphorylation)： 　　在叶绿体ATP合成酶催化下依赖于光的由ADP和Pi合成ATP的过程。 　 　光反应(light reactions)：光合色素将光能转变成化学能并形成ATP和NADPH的过程。 　 　暗反应(dark reactions)： 　　利用光反应生成的ATP和NADPH的化学能使CO2还原成糖或其它有机物的一系列酶促过程。 　 　Calvin 循环（Cavin cycle）: 　　也称之还原戊糖磷酸循环（RPP cycle: reductive pentose phosphate cycle），C3途径（C3 pathway）。在光合作用期间，将CO2还原转化为糖的反应循环。是植物用于固定二氧化碳生成磷酸丙糖的循环途径。 　 　C4途径（C4 pathway）： 　　一些植物中固定碳的途径，其特点是通过使CO2浓缩减少光呼吸。在该途径中，在叶肉细胞CO2被整合到C4酸中，然后C4酸在维管束鞘细胞被脱羧，释放出的CO2被Calvin 循环利用。 　 　光呼吸（photorespiration）： 　　植物依赖光摄取氧进行磷酸乙醇酸代谢的过程。光呼吸之所以发生是由于O2可以与CO2竞争核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶的活性部位。 β氧化途径(βoxidation pathway)： 　　是脂肪酸氧化分解的主要途径，脂肪酸被连续地在β碳氧化降解生成乙酰CoA，同时生成NADH和FADH2，因此可产生大量的ATP。该途径因脱氢和裂解均发生在β位碳原子而得名。每一轮脂肪酸β氧化都是由4步反应组成：氧化、水化、再氧化和硫解。 　 　肉毒碱穿梭系统（carnitine shuttle system）: 　　脂酰CoA通过形成脂酰肉毒碱从细胞质转运到线粒体的一个穿梭循环途径。 　 　酮体(acetone body)： 　　在肝脏中由乙酰CoA合成的燃料分子（β羟基丁酸、乙酰乙酸和丙酮）。在饥饿期间酮体是包括脑在内的许多组织的燃料，酮体过多将导致中毒。 　 　柠檬酸转运系统（citrate transport system）: 　　将乙酰CoA从线粒体转运到细胞质的穿梭循环途径。在转运乙酰CoA的同时，细胞质中的NADH氧化成NAD＋、NADP＋还原为NADPH。每循环一次消耗2分子ATP。 　 　酰基载体蛋白（ACP, acyl carrier protein）： 　　通过硫酯键结合脂肪酸合成的中间代谢物的蛋白质（原核生物）或蛋白质的结构域（真核生物）。 生物固氮作用(Biological nitrogen fixation)： 　　大气中的氮被还原为氨的过程。生物固氮只发生在少数的细菌和藻类中。 　 　尿素循环（urea cycle）: 　　是一个由4步酶促反应组成的可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的代谢循环。该循环是发生在脊椎动物肝脏中的一个代谢循环。 　 　脱氨(deamination)： 　　在酶的催化下从生物分子（氨基酸或核苷酸分子）中除去氨基的过程。 　 　氧化脱氨（oxidative deamination）： 　　α-氨基酸在酶的催化下脱氨生成相应α-酮酸的过程。氧化脱氨过程实际上包括脱氢和水解两个步骤。 　 　转氨酶（transaminases）： 

　　也称之氨基转移酶（aminotransferases）。催化一个α-氨基酸的α-氨基向一个α-酮酸转移的酶。 　 　转氨(transamination)： 　　一个α-氨基酸的α-氨基借助转氨酶的催化作用转移到一个α-酮酸的过程。 　 　乒乓反应（ping-pong reaction）： 　　在该反应中，酶结合一个底物并释放出一个产物，留下一个取代酶，然后该取代酶再结合第二个底物和释放出第二个产物，最后酶恢复到它的起始状态。 　 　生糖氨基酸(glucogenic amino acids)： 　　那些降解能生成可作为糖异生前体分子，例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。 　 　生酮氨基酸(acetonegenic amino acid)：那些降解可生成乙酰CoA或酮体的氨基酸。 　 　苯酮尿症（phenylketonuria）: 　　是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引起苯丙酮酸堆积的代谢遗传病。缺乏苯丙氨酸羟化酶，苯丙氨酸只能靠转氨生成苯丙酮酸，病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆积对神经有毒害，智力发育出现障碍。 　 　尿黑酸症（alcaptonuria）: 　　是酪氨酸代谢中缺乏尿黑酸氧化酶引起的代谢遗传病。这种病人尿中含有尿黑酸，在碱性条件下暴露于氧气氧化并聚合为类似于黑色素的物质，从而使尿成黑色。 核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase)： 　　能分解核苷生成含氮碱和戊糖的磷酸酯的酶。 　 　核苷水解酶(nucleoside hydrolase)：能分解核苷生成含氮碱和戊糖的酶。 　 　从头合成(de novo synthesis )： 　　生物体内用简单的前体物质合成生物分子的途径，例如核苷酸的从头合成。 　 　补救途径(salvage pathway)： 　　与从头合成途径不同，生物分子的合成，例如核苷酸可以由该类分子降解形成的中间代谢物，如碱基等来合成，该途径是一个再循环途径。 　 　痛风（gout）： 　　是尿酸过量生产或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆积造成的，尿酸结晶堆积在软骨、软组织、肾脏以及关节处。在关节处的沉积会造成剧烈的疼痛。 　 　别嘌呤醇（allopurinol）： 　　是结构上（嘌呤环上第7位是C，第8位是N）类似于次黄嘌呤的化合物，对黄嘌呤氧化酶有很强抑制作用，常用来治疗痛风。 　 　自杀抑制作用（suicide substrate）： 　　底物类似物经酶催化生成的产物变成了该酶的抑制剂。例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制就属于这种抑制类型。 　 　Lesch-Nyhan综合症（Lesch-Nyhan ）： 　　也称之自毁容貌症，是由于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶的遗传缺陷引起的。缺乏该酶使得次黄嘌呤和鸟嘌呤不能转换为IMP和GMP，而是降解为尿酸，过量尿酸将导致Lesch-Nyhan综合症。 激素（hormone）： 　　一类由内分泌组织合成的微量的化学物质，它由血液运输到靶组织，起着一个信使的作用调节靶组织（器官）的功能。 　 　激素受体（hormone receptor）： 　　位于细胞表面或细胞内结合特异激素并引发细胞响应的蛋白质。 　 　第二信使(second messenger)： 　　响应外部信号（第一信使），例如激素而在细胞内合成的效应分子，例如cAMP、肌醇三磷酸或二酰基甘油等。第二信使再去调节靶酶，引起细胞内各种效应。 　 　级联放大(cascade)： 　　在体内的不同部位，通过一系列的酶促反应来传递一个信息，并且初始信息在传到系列反应的最后时，信号得到放大，这样的一个系列叫做级联系统。最普通的类型是蛋白水解和蛋白质磷酸化的级联放大。 　 　G蛋白(G proteins)： 　　在细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋白质，由α、β、γ三个不同亚基组成。与激素受体结合的配体诱导GTP与G蛋白结合的GDP进行交换，结果激活位于信号传导途径中下游的腺苷酸环化酶。G蛋白将胞外的第一信使肾上腺素等激素和胞内的腺苷酸环化酶催化的腺苷酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。G蛋白具有内源GTP酶活性。 　 　激素效应元件（hormone response elements, HRE）： 　　是指类固醇、甲状腺素等激素受体结合的一段短的DNA序列（12～20
bp
），这类受体结合DNA后可改变相邻基因的表达。 　半保留复制(semiconservative replication)： 　　DNA复制的一种方式。每条链都可用作合成互补链的模板，合成出两分子的双链DNA，每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成。 　 　复制叉（replication forks）： 　　Y字型结构，在复制叉处作为模板的双链DNA解旋，同时合成新的DNA链。 　 　DNA聚合酶（DNA polymerase）： 　　以 DNA为模板催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反应的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性，可用来校正新合成的核苷酸序列。 　 　Klenow 片段(Klenow fragment)： 　　E.coli DNA聚合酶I经部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶I 的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性，但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。 　 　前导链（leading strand）： 　　与复制叉移动的方向一致，通过连续地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA链。 　 　滞后链（lagging strand）： 　　与复制叉移动的方向相反，通过不连续地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA链。 　 　冈崎片段(Okazaki fragments)： 　　相对比较短的DNA链（大约1000核苷酸残基），是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段，这是Reiji Okazaki 在DNA合成实验中添加放 射性的脱氧核苷酸前体观察到的。 　 　引发体（primosome）: 　　一种多蛋白复合体，E.coli中的引发体包括催化滞后链不连续DNA合成所需要的短的RNA引物合成的引发酶、解旋酶。