【纯学术】以PCR技术和无细胞表观遗传体系获得RUNE替代神明附体
革命机valvrave吧
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幻释冰冥 楼主
首先单看楼主头像就知道,楼主是个上了点年纪的人;故而这些打段式的言论大概已经不甚符合这个文字碎片化的时代潮流。但是考虑到楼主也是个从中学二年就开始中二直至现在都尚未痊愈的ACG住民,而且从高一银魂开播一直追随银桑直至我大学毕业银魂完结,我已然在吐槽这条道路上越走越远。因此在看到革命基关于rune的来源这个设定之时,我的中二吐槽能力瞬间爆表,无论如何都想写点什么来平复我最近一直被压迫在综述地狱的心情。
由于楼主是个生物专业的研究生,于是下面会通过一系列的生物学手段来说明神明附体的代替物的存在可能。这将是一篇半学术性的文章,所以我不确保所有人都能喜欢它,但我至少能保证它的科学性……
以上!
2013年11月16日 05点11分 1
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幻释冰冥 楼主
今年4月,我还沉浸在魔王大人的日常欢乐中不能自拔,好姬友荷偲给我推荐了VVV。说真的最开始是冲着它的基去的,于是看到晴人小天使与黑长直的H我就崩溃到不想看了……但好歹我还是坚持到了第二季。于是在物理老师表示rune的来源是DNA、感情、记忆、生命力,紧接着就是爆头妹妹的脑内喹啉酸水平和RBC水平等生命体征变化之时,我瞬间开启学术模式:尼玛有个PCR仪不就不用变植物人了吗?!所以说在不必要的地方省钱是多么不明智的战略手段……
另外:关于喹啉酸和RBC对于生命力的影响,这不是我这个专攻肿瘤生物学的苦逼研究僧的专业范围,所以之后我会联合北大医学院神经内科的拉普拉斯同学,再写一篇论述它们的东西。当然那会是猴年马月的事情了啊哈哈哈哈哈。
下面进入正题。我具体讨论如何利用PCR技术和无细胞表观遗传体系量产适合替代神明附体的DNA。
2013年11月16日 05点11分 2
2013年11月18日 12点11分
[冷]高中学渣表示生物从未及格
2013年11月19日 00点11分
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幻释冰冥 楼主

1. DNA
这是一个超级老套的概念。有谁不知道DNA吗?不知道的请举手!很好没有人举手,大家都明白了。但是银八老师还是要重复一下这个重要知识点,不想听的同学请到外面罚站!
DNA是脱氧核糖核酸的简称,主要存在于细胞核内,是控制生命性状的指令集合。DNA中包含可以形成一个完整生命体所需的几近全部的信息。原则上,有了一个生命体的总DNA序列,你就可以再造出这个生命体的无数个副本。
在VVV的设定中,DNA也是储存rune的很好容器。那为什么低等生物或者说非人生物不可以作为VVV的供体呢?这里涉及到另一个概念,即C值,也就是生物单倍体基因组中DNA的总量。理论上,随着进化程度的增高,C值也在不断增高,人类的C值就相当高;因此,低等生物的总DNA所蕴含的rune恐怕还不足以驱动VVV正常运转,那么选取位于进化顶点的人类作为供体可谓是情理之中。
以此推论,只要存在足够多的DNA,那么其中包含的大量rune也必然可以驱动VVV工作,而没必要非得选用活体提供rune。
那么,如何可以在短时间内大量获得DNA呢?
2013年11月16日 05点11分 4
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幻释冰冥 楼主
2. PCR
在PCR技术出现之前,人类为了获得DNA,尤其是某些特定DNA片段,要经过复杂而漫长的处理过程,而PCR彻底革新了这一情况。PCR,即聚合酶链式反应,它是利用2段特异引物、DNA模版、DNA聚合酶、dNTP等物质,经过高温变性、低温退火、中温延伸的反复循环,最终产出大量与模版相同的DNA的技术。这个所谓的大量能有多少呢?一般的PCR是30个循环,那么产物就是230条DNA。当然也可以随个人喜好而对循环圈数进行调整。
虽然根据目前的技术,5kb基本算是个PCR的极限长度,但是随着科技发展,尤其是到了VVV那个年代,再配合一些DNA连接技术,个人认为P出来人类基因组全长的DNA也不是什么难事。
于是通过PCR,我们完全可以得到极多的人类基因组DNA。想要谁的就P谁的;而且只要PCR仪足够多,那还能想要多少有多少。这里要说一句,每台PCR仪同时可以处理至少数十组PCR任务。
当然你可能会在这段论述中找到我的破绽,比如:PCR出来的DNA完全是模版的复制,不存在变化,而如果特定的碱基序列只能储存一定量的rune,那么PCR的结果只是增大了容器而没有增加rune的量啊!
2013年11月16日 05点11分 5
就是人工控制DNA复制的技术吧!
2013年11月17日 13点11分
自带吐槽好评[真棒],我也想说这就像复印,没用的吧,至于提升变异水平,这有效的变异又能有多少呢?
2013年11月17日 16点11分
level 12
……PCR我记得。是利用RNA容易复性来着
2013年11月16日 05点11分 8
RTpcr?
2013年11月16日 05点11分
回复 幻释冰冥 :嗯……无非是转录什么的,还有断链罢了。之后再复原,我记得应该是这样的
2013年11月16日 12点11分
回复 长门有希的败走 :呃。。。断。。。断链?这个技术木有见过的说~
2013年11月16日 12点11分
回复 幻释冰冥 :不是说将RNA进行断链再之后重新组合吗⊙▽⊙我的老师这样告诉我的…
2013年11月16日 12点11分
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幻释冰冥 楼主
4. 无细胞表观遗传体系
长久以来,记忆的形成和储存都深刻地困扰着科学家;像克莉斯缇娜那样深入研究了记忆存储方式并成功将其提取还传回过去的事件可以说只发生在αβγ世界线上。另外比翼连理神马时候出中文版啊?!咳咳扯远了。总之虽说没有突破性进展,但是人类对于记忆的认识还是在时刻深化着的。比如,研究表明(具体哪项研究大家请自推PubMed),记忆的形成与神经元染色质的甲基化去甲基化、乙酰化去乙酰化、磷酸化去磷酸化、你妹化去你妹的等等有关,哎有奇怪的东西混进去了……
所谓的染色质,是包含了DNA、组蛋白、非组蛋白等等一系列杂七杂八东西的复合物;而这些甲基化神马的,并非是在DNA上进行的操作,而是在组蛋白上进行的修饰。不涉及DNA具体序列的变化,而通过组蛋白修饰、基因调控、核型改变等实现的遗传,即为表观遗传。
细胞在自然状态下,染色质的状态是时刻变化着的,极其复杂,完整重现它几乎是不可能的。但是经过大量研究,完全可以找出与记忆有关的基因靶点及其具体调控方式,于是通过一些包括甲基化酶、去甲基化酶等存在的表观遗传体系,就可以或多或少地重现记忆过程。
之所以使用无细胞体系,是为了避免出现非可控的记忆过程。想想看,如果加强悲伤记忆,需要的是A基因a位点甲基化,我们当然不希望因为细胞中天然存在的去甲基化酶把这个千辛万苦得到的悲伤消除。而无细胞的表观遗传体系中有什么酶、酶的量和活性是多少、酶的作用时间和地点等等,都是能够人为控制的,甚至可以通过计算机手段远程精确调控。这就显示出了该方法的极强可操作性。虽然截止到目前,这种体系是不是存在我不敢确定,因为没去找相关文献……
2013年11月16日 05点11分 9
每次看到表观遗传学就特别想吐槽,直到现在我都认为这东西的可信性太低了……
2013年11月16日 08点11分
回复 纯化蛋白 :其实现在表观遗传特热,而且大多生物过程都涉及表观遗传,毕竟你不能要求那么一点的碱基没有任何变化就能形成多彩生命体嘛~
2013年11月16日 08点11分
回复 幻释冰冥 :siRNA就能够解决很多问题,之所以吐槽表观遗传学是因为它的重复性太差,即使几篇里程碑级的文献到现在重复出来的报道都很少
2013年11月16日 08点11分
回复 纯化蛋白 :但是siRNA的问题在于不能100%地进行沉默,所以如果要里程碑,还是要做knockout.当然现在siRNA已经是常规技术了。另外包病毒神马的好麻烦啊
2013年11月16日 11点11分
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幻释冰冥 楼主
5. 联合使用PCR和无细胞表观遗传体系
现在来看看我们手中的材料。
我们有PCR仪若干台,晴人小天使或者他的小伙伴们的基因组样本一份,PCR体系若干份,不保真的DNA聚合酶一份,无细胞表观遗传体系一份。
于是我们可以开始量产工作了。
首先对基因组样本进行不保真PCR,一轮30圈,这最多花费2个小时。
之后对产物进行精细的表观遗传修饰,这要花多长时间我不清楚,姑且算是72小时好了。
最后在74小时之后,我们得到了N*230份VVV驾驶员已经修饰好的全基因组DNA,它们被装在N个0.5ml的tube管里。
这就相当于我们得到了N*230个驾驶员,而且他们有着完全不同的记忆。就算这些基因组不都是AI爱吃的,在如此巨大的基数中她总会找到合适填饱自己肚子的食物;即便她是像INDEX一样的60m巨人级吃货,我们也还可以通过重复74小时若干次,来无限量供应给她食物。当麻表示需要办一张PCR餐饮店的会员卡,布拉德H表示也需要一张但是因为在逃亡过程中(或者说锁敌过程中)没有钱所以这次也是霸王餐。
2013年11月16日 05点11分 10
你确定要用不保真的吗?你想做个缺陷体出来吗……
2013年11月16日 08点11分
回复 纯化蛋白 :那个我被你的名字吸引到了!~另外我的确想弄不保真,毕竟在复制重要基因的时候可以换成保真的酶嘛~
2013年11月16日 08点11分
回复 幻释冰冥 :好吧,我比较奢侈,除了鉴定基本都是用保真的……
2013年11月16日 08点11分
回复 纯化蛋白 :哎我突然想到,把涉及感情神马的蛋白都提纯出来,然后加进去说不定也很好玩~
2013年11月16日 08点11分
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幻释冰冥 楼主
6. 结论
通过运用PCR和组蛋白修饰,我们得到了超高量的DNA和模拟记忆,这很有可能去填饱AI的肚子。
但是就目前来看(我说的是动画进度而非科技水平),AI对于人类感情也有很强的食欲,并且“生命力”这一看不见摸不着的东西似乎能够蕴藏极高浓度的rune。而如何以科学手段再现这两种来源的rune看样子也是个值得研究的课题。
下次我将联合拉普拉斯就“生命力”这一主题展开探讨,以求得全面替代神明附体的谜样物体……
2013年11月16日 05点11分 11
回复 rynax103 :其实科学就是从宗教中分离出来的,说不定以后若干年,它们又会合并呢?反正现在已经有这个趋势了
2013年11月16日 11点11分
我认为感情是人体内内分泌系统分泌的各种激素综合作用和神经活动的产物!
2013年11月17日 13点11分
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幻释冰冥 楼主
7. 关于本文的声明
文章中涉及了一些生物学专业词汇,大家有不懂的可以联系我或者直接推度娘。
无细胞表观遗传体系是我YY出来的东西,理论上可以存在,而现实情况我的确没去查证,很抱歉。但是无细胞转录翻译体系是有的,所以这东西大概也有吧,至少近几年会出现吧。
码字不少,虽然很可能没什么人看,但如果要转,请先联系我。
2013年11月16日 05点11分 13
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来来炸出一个生物专业的,按理说RUNE先炸出来的应该是物理科学系的呀٩(๑❛ᴗ❛๑)۶
生化只学B级的我只好站在路边围观噜。
2013年11月16日 05点11分 14
物理专业的表示RUNE的设定是伪科学 满身槽点所以索性不吐
2013年11月16日 07点11分
回复 neolcaax :不是有人扯到了最近的什么上帝粒子了嘛٩(๑❛ᴗ❛๑)۶
2013年11月16日 07点11分
回复 一衣白水 :[啊]倒是见过一个那样的贴子我还委婉地回复说那个楼主在乱讲...不知道是不是你看的那个...ps:学生物的楼主我没有说你... 你的这篇paper我看不懂
2013年11月16日 08点11分
回复 neolcaax :不知道噜……我是在B吧看到的,没戳进去因为智商不够用٩(๑❛ᴗ❛๑)۶ 其实我一直有个误会,现在物理学意义上的粒子已经不是经典物理学里的硬球形象了吧?
2013年11月16日 08点11分
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幻释冰冥 楼主
最后@荷偲
2013年11月16日 06点11分 15
我这是造的什么孽呀……
2013年11月18日 09点11分
回复 荷偲 :没有,只是你把我拉进了一个很有趣的圈子~
2013年11月18日 14点11分
回复 幻释冰冥 :[拍砖]
2013年11月19日 16点11分
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能简明易懂点么[狂汗] 如果单纯考虑机娘的喂养问题的话 饲料怎么看也不是DNA实体 VVV这个就是套个名词好让这个魔幻产物变成科幻产物
2013年11月16日 06点11分 16
只是从DNA切入而已,实际目的是吐槽,嗯嗯
2013年11月16日 06点11分
level 7
好高高高能∑(っ°Д°;)っ!
2013年11月16日 06点11分 17
level 7
没用的。RUNE的设定类比就像未证实的量子为原子的根源构成一样。麻理叶那集不是说了么?RUNE过分提取,连红血球都几乎消失了,那可是造血细胞啊!更别说那个脑浆之类构成物质神马神马质了。RUNE的定位很模糊的,连记忆这种DNA只能提出一部分变成实体的虚构玩意都能直接作为能量去用,这。。。不过不得不说大河内的脑洞太可怕了
2013年11月16日 06点11分 19
纠正一个概念性问题:造血细胞其实就是造血干细胞的俗称,它可以分化出不同的血细胞,包括红细胞、中性粒细胞、巨噬细胞等等;而红细胞为终末分化细胞,它的寿命很短暂,因为没有细胞核更不能再产生别的细胞。 关于rune是否存在,不是我这篇文章讨论的核心,这是理论物理学或者哲学问题,嗯嗯!~
2013年11月16日 07点11分
回复 幻释冰冥 :赞一个 红细胞的减少可解释为造血干细胞不向该方向分化 但 毛球在短时间内红细胞锐减 又该如何解释呢?
2013年11月16日 10点11分
回复 悲催的E75 :嗯。。。你的解释也很新锐呢,我完全没往这个不分化的方向想过~但是具体的我目前也解释不清,我之后会联合北医拉普拉斯同学一起探讨这个问题的,到时也请多多关注!~
2013年11月16日 11点11分
回复 幻释冰冥 :看来这作品启发了你什么的样子。果然高科技靠的就是想象力?加油![真棒]
2013年11月16日 12点11分
level 11
膜拜
2013年11月16日 08点11分 20
level 11
2013年11月16日 08点11分 21
level 4
高中生物就最高考过1次60的路过
(苦逼)
2013年11月16日 10点11分 22
level 13
生物信息是怎么变成能量的。。。如果发明出记忆移植,就等于人不死了吧
2013年11月16日 10点11分 23
你真是问对人了,我本科是学生物信息的~但是信息转化为能量这个问题,果然还是得问大河啊,我估计答案在AI上(这不是人尽皆知吗?!),虽然他会不会借谁的口说出答案就是未知了。另:生物信息学很有趣,是数学、计算机科学、生物学的交叉,相当前沿也相当有用
2013年11月16日 12点11分
level 10
虽然也是偏生物的,但我觉得露珠PCRDNA的估计机娘是不吃的,这估计就是假货和真货的区别了,其实我个人认为DNA主要是物理结构的基础
2013年11月16日 12点11分 24
这就和文字能过传达思想一样嘛。你看到的是线的排列组合,但是理解到的思想,酱紫。但是本文的论点不在这里嘛~明明基础是“RUNE存在于DNA,机娘要吃RUNE而不管它的来源”嘛~所以这种问题人家才不要深入解释呢坟蛋!~
2013年11月16日 12点11分
回复@幻释冰冥 :扯到这个我觉得这已经是哲学上的问题了,你这应该是唯物吧,我觉得rune这问题上偏唯心
2013年11月16日 12点11分
回复 yume桑 :对,同样觉得rune是主观唯心的。。(因为只有这样自己才懂。。)
2013年11月19日 17点11分
level 16
好长[狂汗]
2013年11月16日 13点11分 25
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