概略划分章节编号 篇名 登场主角 回数 收录的单行本(集) 第一章 红、绿、蓝篇 小智、小茂、小蓝 1-40 1-3 第二章 小洛篇 小洛、小智、小茂、小蓝 41-90 4-7 第三章 金.银.水晶篇 小金、小银、克丽丝、小智、小茂、小蓝、小洛 91-180 8-15 第四章 红宝石.蓝宝石篇 路比、莎菲雅 181-267 15-22 第五章 火红.叶绿篇 小智、小茂、小蓝、小洛、小银 268-302 22-26 第六章 绿宝石（对战开拓区）篇 绿宝石(无正式中译)、小智、小茂、小蓝、小洛、阿金、阿银、克丽丝、路比、莎菲雅 303- 26- 第七章 钻石、珍珠篇 钻石、珍珠(尚无正式中译) 连载中 尚未收录 

出版情形国家或地区 发行集数 出版社 连载杂志 最新出版讯息 书写文字 台湾 20 青文 快乐快乐 - 正体中文 大陆 22 吉林美术出版社 龙漫 4月初出版22册 简体中文 香港 17 香港青文出版社 快乐龙 - 正体中文 美国 7 Viz Media - - 英文 新加坡 22 创艺出版社 - - 英文 日本 26 小学馆 珍珠钻石：小学四至六年生绿宝石：Pokemon Wonderland 8月28日出版第27册庆祝十周年，分限定版及普通版！ 日文

作者介绍在第一至九集是由真斗负责作画。但因为手疾，第十集以後改由山本智接手。在衔接期间，编辑部特别安排让原本的主角（阿金、阿银）失踪。由於当时仍在第三章连载期间，所以山本智的画风不能被一些人接受。当进入第四章红蓝宝石篇後，山本智便开始真正拿出了自己的画风。脚本则为日下秀宪。

章节《神奇宝贝特别篇》并不和一般漫画故事一样，同一则故事一直连续下去，而是采取「章节」制。所谓章节，即是每一章节都有互不隶属的故事，且会有新的主角出现，但和以前的章节还是会有一定的相关性，每个角色、基本设定、感情、时间等，基本上都是相同的。目前，《神奇宝贝特别篇》已经有了七个章节，也有了许多主角

第一章（红.绿.蓝篇）主角：小智、小茂、小蓝 反派：火箭队 故事大意： 南国城镇-真新镇里，有一位非常喜爱神奇宝贝的少年「小智」。为了让自己变的更强，小智造访大木研究所，并得到博士的认可，从他那得到了一个神奇宝贝图鉴和神奇宝贝「妙蛙种子」。大木博士还告诉他，只要将图鉴资料全部收集完成，他就能成为很厉害的神奇宝贝训练师。小智并朝著这个目标，展开了他的旅程。旅途中，小智不时会遇到大木博士的孙子「小茂」，两人在旅程中亦敌亦友地互相成长；另外还遇到了一个神秘而机智的少女「小蓝」。火箭队是个企图利用神奇宝贝来获取更多金钱及利用神奇宝贝的力量征服世界的邪恶组织，因为真新镇拥有适合神奇宝贝居住的纯净环境，於是他们打算将真新镇占为己有。小智、小茂、小蓝等人，因此来到火箭队的大本营-金黄市的希尔佛公司和火箭队进行决战，他们能够成功吗？之後，小智来到了常磐森林。森林似乎发生了异变，使得在里面迷路的小女孩吓得惊魂未定。还好，小智将这个小女孩送回了她的家-常磐市。在常磐市里，小智也和火箭队首领-坂木老大进行了激战。之後，小智、小茂、小蓝等人，参加了三年一度的神奇宝贝联盟赛。到底冠军会奖落谁家呢？......

第二章（小洛篇）主角：小洛、小智、小茂、小蓝 反派：关都四天王 剧情大纲： 在小智等人与希尔佛公司激烈对战後的两年。某天，小智接到以四天王希巴所署名的挑战书，接受挑战後下落不明，只剩下伤痕累累的皮卡回到大木研究所。 就在大木博士等人为了寻找小智而忙的不可开交时，戴著草帽的神秘少年「小洛」出现了。他取得大木博士的认可後，带著皮卡踏上寻找小智的旅程。 在寻找小智的这段期间内，小洛数次和关都四天王发生战斗。其实关都四天王的真实目的是想要建立神奇宝贝的理想国，消灭所有人类，只留下同理念的优秀训练家。为达到此目的，四天王也派了他们的军团，抢夺能产生强大能量的八个练功场首领徽章。 之後，小洛来到红莲岛，听从练功场首领夏伯的话，组成搭档前往四天王的大本营-苏芳岛。在那里，小洛遇上了小蓝、正辉、曾为小洛做过特训的小茂以及火箭队三干部。由於目的相同，於是他们决定暂时联手，分成四组，各自和四天王中的一人对战。究竟他们的策略能够成功吗？而小洛的草帽里又隐藏著什麼样的秘密？

第三章（金.银.水晶篇）主角：小金、小银、克丽丝、小智、小茂、小蓝、小洛 反派：戴面具的男子及火箭队残党 故事大意： 关都四天王之战过後一年，新的冒险在城都地区展开。和神奇宝贝情同手足的少年「小金」，为了追查从空木研究所偷走小锯鳄及从大木博士那偷走新神奇宝贝图鉴的神秘少年「小银」，带著火球鼠等神奇宝贝与好不容易争取回来的新图鉴一起踏上旅程。 另一方面，为了蒐集齐全图鉴的资料，大木博士找来了捕获专家「克丽丝」。三人究竟会在什麼样的情况下聚集在一起呢？而水君、雷公、炎帝也从地震後的圆朱市苏醒了。他们会为训练师的旅程带来什麼样的变化？ 另外，阻挡在三人面前的神秘敌人-戴面具的男子，其真面目似乎是练功场首领，为此神奇宝贝协会召集了关都和城都的练功场首领，打算进行对抗战，并从中找出犯人。至於小智等关都的主角们也因为各自有事而来到了城都地区，和拥有新图鉴的三人会合。 到底戴面具的男子召集火箭队残党、捕捉凤王和洛奇亚的目的为何？拥有历代图鉴的少年少女们能顺利阻止他的阴谋吗？练功场首领也将进行精采的对决...！紧张刺激的第三章故事，就此展开！

第四章（红宝石.蓝宝石篇）主角：路比、莎菲雅 反派：火岩队&水舰队 故事大意： 「戴面具的男子」事件发生後两年，在芳缘地区，一个刚从城都地区搬来这的少年「路比」，为了参加这个地方的神奇宝贝华丽大赛，不顾父亲的反对，偷偷离家出走，没想到却因为因缘巧合，遇上了野性化少女「莎菲雅」。 莎菲雅是小田卷博士的女儿，由於莎菲雅是以称霸芳缘地区所有练功场为目标，两人因此起了争执，於是并订下了80天的约定，看谁最快在期限内完成目标，以证明自己的实力，就这样，两人踏上了各自的旅程。 同时，芳缘地区的两个神秘集团-火岩队和水舰队也在蠢蠢欲动，他们的目的是要让超古代神奇宝贝-固拉多和盖欧卡复活，好建造自己的理想世界，为此，芳缘地区的练功场首领紧急召开会议，商讨对策。 究竟有没有人能够阻止这两大集团的野心呢？路比和莎菲雅是否能达成自己的目标呢？又是什麼命运将他们两个紧紧缠在一起呢？全新的传说即将展开！

第五章（火红.叶绿篇）主角：小智、小茂、小蓝、小洛、小银 反派：火箭队 故事大意： 固拉多和盖欧卡大战後半年，小智与小茂好不容易回到了真新镇，却发现博士不在家，并要求他们将图鉴缴回，还给了他们一张船票。他们便搭了船前往彩虹群岛，并在船上碰见了小蓝，在彩虹群岛会发生什麼样的事呢？ 另一方面，关都地区的常磐市里，小洛碰见了小银。小银透过记忆，经过小洛的绘画，在常磐市道场找到了可能是他爸爸的铜像。原来，小银的爸爸就是坂木？惊讶之馀，在常磐森林里他俩也碰到了一场激战！ 第五章故事，热闹展开！

第六章（对战开拓区篇）主角：Emerald(绿宝石，目前无中文译名)、克丽丝、路比、莎菲雅 故事大意： 第五章过後两个月。在芳缘地方新开设的「对战开拓区」中，绿宝石竟然要「七天内称霸所有战斗设施」？本篇目前在Pokemon Wonderland（不定期发售）中连载，第一至六章十名图鉴所有者都已集结！

主要角色特别篇第一至三章主角合照，由右至左分别为小蓝、小茂、小智、小洛、阿金、阿银、克丽丝

小黄（Yellow） 人物设定：漫画特别篇自创人物 全名：イエロー・デ・トキワグローブ（常磐森林的小黄） 特殊能力：神奇宝贝治愈者 性别：女 血型：Ａ型 出身地：常磐森林 年龄：第一章9岁（第3集中登场）／第二章11岁／第三章12岁／第五章14岁／第六章14岁 生日：3月3日（双鱼座） 登场单行本：3~7･9･11~15･24~26 第二章的主角，是个有很长马尾的女生。在常磐森林出生，继承了常磐森林所赐予的特殊能力(可用「气」读取神奇宝贝的心灵，也可以治愈神奇宝贝)，这个能力每十年传承一次（另外也有传承给小渡）。曾在常磐森林迷路被小智所救，从而对小智产生好感，後听从小蓝的指示，出发寻找小智。为了保全小智与自己的良好关系，因此会刻意戴上草帽来掩饰她真正的性别。不擅长收服神奇宝贝，也并不喜欢让神奇宝贝战斗。容易打瞌睡。

Emerald［绿宝石，目前没有中文译名］ 人物设定：漫画特别篇自创人物 特殊能力：神奇宝贝对战者（暂） 性别：男 血型：ＡＢ（ＲＨ－）型 年龄：第六章11岁 生日：5月31日(双子座) 登场单行本：26 主要在绿宝石（对战开拓区）篇中登场。是真正的芳缘地区第三图鉴拥有者。

队伍第一章 红.绿.蓝篇小智队 妙蛙(妙蛙种子→妙蛙草→妙蛙花)皮卡(皮卡丘)快泳(蚊香蛙→快泳蛙)卡比(卡比兽)暴鲤(暴鲤龙 用大钳蟹和小霞换的)化石(化石翼龙)小布(伊布, 存在电脑里) 小茂队 喷火龙(小火龙→火恐龙→喷火龙)哥达鸭飞天螳螂豪力→怪力(与小智交换进化)比雕九尾3D龙 小蓝队 小龟(杰尼龟→卡咪龟→水箭龟)小胖丁(胖丁)小皮(皮皮→皮可西)小百(百变怪)小墨(墨海马)小尼多(尼多兰♀)

第二章 小黄篇小黄队 皮卡(小智的皮卡丘)小拉拉(拉达→小拉达)小嘟嘟(嘟嘟→嘟嘟利)小毛虫(绿毛虫→铁甲蛹→巴大蝴)小菊石(菊石兽→多刺菊石兽)小隆隆(隆隆石→隆隆岩) 小智队 妙蛙(妙蛙花)快泳(快泳蛙)卡比(卡比兽)暴鲤(暴鲤龙)化石(化石翼龙)小布(伊布) 小茂队 喷火龙哥达鸭飞天螳螂比雕怪力九尾3D龙 小蓝队 小龟(水箭龟)小胖丁(胖丁)小皮(皮可西)小百(百变怪)小墨(墨海马)小尼多(尼多兰→尼多娜)布卢(小蓝的第七只神奇宝贝)

第三章 金.银.水晶篇小金队 爆太郎(火球鼠→火岩鼠→火暴兽)尾太郎(长尾怪手)蛙太郎(蚊香蝌蚪→蚊香蛙→牛蛙君)向日太郎(A|zh-tw:向日种子→向日花怪;zh-hk:向日种子→向日花怪)胡太郎(胡说树)巨翅太郎(巨翅飞鱼)波克太郎(波克比，寄放在空木博士研究所)皮丘(皮卡和丘丘生的蛋孵化出的)雷公 小银队 小锯鳄→蓝鳄→大力鳄狃拉黑暗鸦海刺龙→刺龙王(以布卢和小蓝交换墨海马，後进化，之後和阿金交换再进化)圈圈熊暴鲤龙(红色)班吉拉(向小渡借的)炎帝 克丽丝队 百万蹦跳(菊草叶→月桂叶→大菊花)风速蹦跳(风速狗)天然蹦跳(天然雀)可拉蹦跳(卡拉卡拉，後寄放在空木研究所)派拉蹦跳(派拉斯特)比华蹦跳(比华拉)迷唇蹦跳(迷唇娃，寄放在空木博士研究所，後领出来)水君 小智队 妙蛙(妙蛙花)快泳(快泳蛙)卡比(卡比兽)化石(化石翼龙)小布(伊布→太阳精灵)喷火龙(用暴鲤和小茂暂换)水箭龟(向小蓝借的，还於14集)急冻鸟 小茂队 喷火龙飞天螳螂→巨钳螳螂3D龙→3D龙2怪力哥达鸭铁甲暴龙(道馆主力)比比鸟(道馆用)椰蛋兽(道馆用)奉神犬(道馆用)胡地(道馆用)暴鲤龙(为助小智前往白银山治病，以喷火龙和其暂换)闪电鸟(向小蓝借) 小蓝队 小龟(水箭龟)小胖丁(胖丁球)小皮(皮可西)小百(百变怪)小尼多(尼多娜)布卢(和阿银以墨海马交换而来)急冻鸟(曾借给小智)闪电鸟(曾借给小茂)火焰鸟凯西(寄放在电脑里) 小黄队 皮卡(小智的皮卡丘)丘丘(皮卡丘♀)小拉拉(拉达)小嘟嘟(嘟嘟利)小毛虫(巴大蝴)小菊石(多刺菊石兽)小隆隆(隆隆岩，小智的皮卡加入後暂时离队)

第四章 红宝石.蓝宝石篇路比 ZUZU（水跃鱼→沼跃鱼→巨沼怪）NANA（土狼犬→大狼犬）COCO（向尾猫→优雅猫）RURU（拉鲁拉斯→奇鲁莉安 暂寄放在小光那）MIMI（笨笨鱼→美纳斯）POPO（兹伏奇社长的漂浮泡泡）正电拍拍雪拉比 莎菲雅 小鸡（火稚鸡→力壮鸡→火焰鸡）多拉拉（可可多拉→可多拉→波士可多拉）吼鲸（小田卷博士的吼鲸王）小甲（顿甲）热带龙龙（小田卷博士的热带龙）古空棘鱼负电拍拍

道馆馆长（道馆馆主）要想成为道馆馆长，必须先拿到考试资格，再参加神奇宝贝协会的测验。测验内容是神奇宝贝对战，由考生和神奇宝贝协会的神奇宝贝战斗。协会方的神奇宝贝没有主人，完全依照自己意志行动，而考生可以自由更换神奇宝贝。道馆馆长的主要工作是负责提升该区域老百姓的神奇宝贝的能力，及负责处理各城镇所发生的重大事件。若是挑战者集满关都或是城都的八个道馆徽章，就可以无条件参加神奇宝贝联盟赛决赛。这个规定是自第10次大会开始实行的。

城都地区阿速桔梗道馆馆长，擅长飞行系，掌管飞翼徽章 副业是警察。 新上任的道馆馆长，是个正直有为的青年，希望有朝一日能像爸爸一样厉害。 拥有的神奇宝贝： 比比鸟猫头夜鹰盔甲鸟速天前桔梗道馆馆长（特别篇自创） 阿速的爸爸。和阿四交情不错。 拥有的神奇宝贝： 盔甲鸟 阿笔桧皮道馆馆长，擅长虫系，掌管昆虫徽章。副业是考古任务员。是个热衷於考古的青年，将来的梦想是当虫系神奇宝贝的研究者。 拥有的神奇宝贝： 铁甲蛹 赫拉克罗斯 铁壳昆 飞天螳螂 小茜满金/小金道馆馆长，擅长普通/一般系，掌管正式徽章副业是艺人。 个性活泼，有点小任性。和名DJ胡桃交情不错。 拥有的神奇宝贝： 大奶罐 皮宝宝 宝宝丁 图图犬：已送给小胡桃 小松（香港无线电视译作松叶）圆朱道馆馆长，擅长幽灵系，掌管魅影徽章拥有千里眼的能力，亦以此为副业。虽有千里眼却也无法追查凤王的下落，希望有朝一日能目睹它的身影，和以水君为目标的南其交情不错。 拥有的神奇宝贝： 鬼斯 梦妖 阿四湛蓝道馆馆长，擅长格斗系，掌管打击徽章是小茂的师父。经常做自我锻鍊，是个对自己要求很严格的人拥有的神奇宝贝： 快泳蛙 火爆猴 怪力 沙瓦郎 柯波郎 阿蜜浅葱道馆馆长，擅长新类型－钢系，掌管钢铁徽章 拥有「铁璧般防御女子」的外号，是个心地善良的训练家。 拥有的神奇宝贝： 光儿/小光（电龙） 波克基古 三合一磁怪 小刚(大钢蛇) 柳伯卡吉道馆馆长，擅长冰系，掌管冰之徽章副业是雕刻家 城都地区道馆馆长的主将，同时也是戴面具的男子的真实身分。因为以前的过错，造成小乘龙失去双亲，为了弥补过错，所以需要具有时空移转能力的雪拉比，因而进行如此庞大的计画。拥有的神奇宝贝 小海狮 小山猪 信使鸟 乘龙 凤王(已挣脱柳伯的控制。) 洛奇亚(已挣脱柳伯的控制。) 雪拉比(已挣脱柳伯的控制。) 小椿烟墨道馆馆长，擅长龙系，掌管升龙徽章是渡的表妹。拥有的神奇宝贝： 海刺龙 哈克龙

关都四天王目标是创造出神奇宝贝的世界。除了厉害的训练家之外，不需留下任何人类。反对人类恣意破坏环境。实力在道馆馆长（道馆馆主）之上。康娜(科拿)擅长冰系。利用人形冰块可以使对方的身体在相同地方被冰封。 拥有的神奇宝贝： 大舌贝 铁甲贝 呆河马 河马王 迷唇姐 白海狮：由小海狮进化而来 乘龙 希巴是个自我要求十分严苛的热血战斗者。擅长使用格斗系的神奇宝贝。 他的沙古拉不只脚能伸长，连手也能伸长。而他的怪力则留有进化前的腰带，以保留力量。 拥有的神奇宝贝： 沙瓦郎 艾比郎 大岩蛇 腕力：菊子给的格斗军团 怪力：菊子给的 巴尔郎 菊子擅长幽灵系。和大木博士有过节。擅长死亡化妆术（控制阿柏蛇的花纹，而使其能力上升）。而他的耿鬼拥有潜入敌人的影子里的能力。拥有的神奇宝贝： 鬼斯 鬼斯通：除主力外，另有组成幽灵军团 耿鬼：除主力外，另有组成幽灵军团 阿柏怪 大嘴蝠 大舌贝：冰军团 铁甲贝 腕力：格斗军团 怪力 渡擅长龙系。是小椿的表哥。是常磐森林出生的人，与小黄一样读取神奇宝贝的心灵、治愈神奇宝贝。他的攻击方式分成四种：控制天气、利用双迷你龙战斗、飞翔於天空和穿越海洋、控制能源波方向，前二者用於不怎麼强大的对手，後二者用於厉害的对手。拥有的神奇宝贝： 化石翼龙：除主力外，另有组成龙军团 哈克龙(*2)：其中一只由迷你龙进化而来，除两只主力外，另有组成龙军团 暴鲤龙 快龙：除主力外，另有组成龙军团 班吉拉：由沙基拉进化而来