格式化数据库：
makeblastdb.exe -in rat.fasta -parse_seqids -hash_index -dbtype prot
-in参数后面接将要格式化的数据库，-parse_seqids, -hash_index两个参数一般都带上，主要是为blastdbcmd取子序列时使用，-dbtype 后接所格式化的序列的类型，核酸用 nucl，蛋白质用prot
BLAST：
blastn -db database_name -query input_file -out output_file -evalue evalue -word_size 初始精确匹配的长度
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1763/