我是这样设想的,那个世界也许是人类已经灭亡了的世界,计算机已经完全主宰一切,但是却历史上在地球上生存的人类的一切特性(如愤怒,爱,等等计算机所不能理解的特征)颇感兴趣,于是,就想尽办法制造出类似于人类思维逻辑的意识(尼奥,莫菲斯,等等其他人都是),母体,锡安,都是为这一目的而设计出来的巨大程序载体(所有人类意识程序).
于是计划开始了,但是计算机经过编制虚拟人格系统后发现有很多漏洞,于是将散布在这些虚拟人格程序中的漏洞集中起来创造出一个与现有系统不相符的人格程序(就是救世主),并以它为蓝本创造出其他一些人格程序,在计算机所设计的另一个载体中繁衍生息一段时间,然后在救世主充分带回了出现漏洞的原因代码后再让它返回到源主机系统,以完成改良升级.
第一代虚拟人格育成系统计算机自以为是最完美的,一切都是那么的美好,但是,一个完美同时也是一个不朽的失败,(程序基本全数崩溃,于是,计算机开始在下一代母体中增加一些不完美的元素,类似贫穷,失业等挫折,然后到了第二代虚拟人格系统,又发现有不完美之处,但是不至于一无是处,于是开始有漏洞修复载体程序（命名为锡安）被编制以修复漏洞,并利用救世主这一个体人格程序将反馈给主控中枢,以完成升级，然后锡安被摧毁，漏洞仍旧会有但越来越少（后面只有百分之一了），下一个锡安将再次被建造，如此循环往复。。。。
在经过了几代升级之后,计算机开始了解人类情感这一构成要素,于是产生了先知这样的窥探人格程序内心的程序,,以更高程度的对人类这种生命体进行解析,升级到近乎与真实人类完全相同的目的
但是,由于先知这一程序是负责窥探人格程序内心的,因而开始出现与理性相对的感性,产生类似于人类的爱与怜悯的感性情绪，并对人格程序被不断破坏和重造没有丝毫自由的生活感到于心不忍，最终，决定铤而走险，试图挽救注定被毁灭的人格程序。
于是，在第五代救世主重新回归主机，锡安被毁灭，母体再次被重塑，下一代锡安和救世主后，先知下定决心要帮助下一代的人格程序免遭毁灭，并开始暗示甚至改变人格程序，以达到控制并保护它们的目的。这才有了费奥斯对救世主的执着（刚开始就被先知设定成这样的也说不定），然后尼奥被找了出来，接受训练，有了超越母体世界一切的能力，然后被**追的穷途末路，被打死又复活，并改写**的代码将其摧毁，由于**程序看到的是自己已经杀死的尼奥，但是又是被尼奥打死的，逻辑严重不符，导致本来应是母体内**的它转变为了病毒，然后尼奥顺便谈了场恋爱，在感受到了人性至真至纯的爱后在面对设计师给的两个选择时，走了挽救自己心爱的人的路，而不是傻傻的又是返回代码之源等着再一次的循环，然后在火车站与一家程序对话后发现原来程序也有爱，然后由个爱升华为博爱，在发现了程序和之前五代运行方式不一样时，计算机决定毁灭锡安，然后由于史密斯这一顽固并危害计算机病毒而且只有尼奥能消失的存在-_-|||，给了尼奥在计算机主宰的世界里第一次提出要求的权利，那要求就是和平，然后尼奥中和了自己的负面—史密斯，然后锡安的人格程序依然卖弄温情，于是计算机暂时不能去摧毁和重塑人格程序的世界了，并且让部分在母体内渴望自由的人格程序进入锡安获得自由，和平到底能维持多久呢？
这一切看似布满选择的流程其实都是在程序的严密控制之下的，其实，所谓人类完全是被主程序玩弄于股掌之中的，并且是由程序创造出的程序，哈哈，真是讽刺，分析完毕。

说得很好！

不是没可能。此假设可能为真，

史密斯说地球恐龙时代再到人类时代再到机械智能时代是发展潮流，如果地球真这样发展那么到最后地球上没有生物上的人及其它动植物，都被机械智能取代，那么人类时代也只是地球进化史的一环，成就机械智能时代的一环，而人类的纯意识也就还可以称作“人”的电脑里的人都会消失，机械智能时代会铲除一切那怕是存在硬盘里具有人都意识的“人”，也就是人类彻底消失，在地球上和电脑里都彻底消失，地球的主宰是智能机械…地球进化史如果真这样发展的话那么人类从现在起就该砸掉所有的电脑防止人类被智能机器文明取代…