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grsdmz 楼主
[一楼喂熊]
2011年10月21日 13点10分 1
level 6
grsdmz 楼主
2011年10月21日 13点10分 2
level 3
新手请教!请问一下,已知microRNA,如何查它的编码基因序列,以及该序列所在的染色体位置呢?
2012年07月22日 06点07分 3
这个库里不是写的很清楚吗?随便查一个,在Community annotation这一大段中The human microRNA-21 gene is located on plus strand of chromosome 17q23.2 (55273409–55273480) within a coding gene TMEM49 (also called vacuole membrane protein).
2012年07月22日 08点07分
@grsdmz 谢谢! 比如我要查hsa-mir-106b-5p的编码基因的位置和名称。 我只有输入hsa-mir-106b,才会有结果。 然后,得到的结果是mir-106b的pre-microrna的Community annotation的内容。 hsa-mir-106b-5p的相关信息在下面,但是只有它的编码基因的sequence。
2012年07月22日 08点07分
@grsdmz 一篇文献中写"Accumulating data revealed that a subset of miRNAs deregulated in HCC,Among them, miR-106b-25 cluster, including miR-106b, miR-93 and miR-25。。。The cluster is hosted in intron 13 of MCM7."他是怎么得到这个cluster在MCM7的inton 13,而不是别的intron上呢
2012年07月22日 08点07分
@von_carolina hsa-mir-106b-5p就是mir-106b的一半吧?位置应该指的是一个。他是怎么得到的,这个是不是测序测得的啊?
2012年07月22日 09点07分
level 6
grsdmz 楼主
2012年07月22日 08点07分 4
level 2
[怒]
2014年10月27日 08点10分 5
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