刚开始玩，郁闷了··········
为什么樱子转校生，而结衣存在？
为什么大家看得到铃乃？
where is it？
到底这是原世界还是结衣世界？
发生什么了？
why？why？
··········

2楼差不多就是真相了
我一开始也很疑惑，打到结衣剧情会知道的

其实就是有着基本和前作世界观相同的另外一个平行世界的故事。
以下剧透慎入：
前作最后两个世界依旧存在，是怎么样还是怎么样。而本作属于另外一个平行世界，是把晶的世界和结衣的世界的相互融合，同时Flyer也出现了问题，才导致了一楼所说的那些情况。但是好处在于，前作中除了结衣铃乃结局意外的那些结局中的悲剧在这个世界不在发生。由于两个世界相互融合，两个世界中的同一个人也融合了，其自身的处于哪种状态则取决于玩家玩的路线。比如樱子路线中，融合后的樱子以晶世界那个樱子的状态为主，即住院多年，做了手术以后最后和晶在一起，过上学园生活。所以即使把这个路线看做前作的AS也是可以的，虽然两者实际上还是属于平行世界的关系。如果玩家选择是最后的铃乃路线，则全员大团圆，所有人的状态都取两个世界中好的那一个，并且解决了自身的问题，樱子一开始就没住院，茉百合从家族的枷锁中解脱，天音兄妹也没出事，所有人都很圆满最后铃乃的结局也和前作的结局一样。