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论述金黄色葡萄球菌 黄色葡萄球菌A蛋白(SPA)分型是基于编码葡萄球菌A蛋白的SPA基因X区域重复序列(24 bp)多态性的一种分型方法,也是第一种专门为研究SA菌株设计的分型方法[93]。由于SPA 分型属于单个多位点的分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也是 调查医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。 目前关分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也是调查医院爆发感 染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。目前关于SPA 分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据库中包含了来自世界各地的SA 菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCm一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同时也是 广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧西林的 特性。目前已经发现了13种不同ence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数据库, 其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST被广 泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其对了解SA菌株进化、探究种群生物学问题具有重要 的临床价值[95]。 本研究拟检测及分析上海市儿童医院儿童脓液感染SA菌株的SPA分型、MLST分型及MRSA菌株 的sccMec分型,以了解MRSA感染的流行病学特征。本研究将为临床治疗和预防儿童SA特别 是MRSA感染提供重要的理论依据,具有重要的临床应用价值。 3.2 材料和仪器 3.2.1 菌株来源同第二部分于SPA分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数 据库中包含了来自世界各地的SA菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比 对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究MRSA 菌株的分子流行病学具有重要意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个管家基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相 应的等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数 据库,其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST 被广泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其究种群生物学问题具有重要的临床价值[95]。 本研究拟检测及分析上海市儿童医院儿童脓液感染SA菌株的SPA分型、MLST分型及MRSA菌株 的sccMec分型,以了解MRSA感染的流行病学特征。本研究将为临床治疗和预防儿童SA特别 是MRSA感染提供重要的理论依据,具有重要的临床应用价值。 3.2 材料和仪器 3.2.1 菌株来源同第二部分,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也是调查 医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。目 前关于SPA分型已报道的重分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也 是调查医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。目前关于SPA分型已报道的重复序列有803个,有1927,数据库中包含了来自世界各 地的SA菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究MRSA 菌株的分子流行病学具有重要意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相应的 等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数据库, 其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST被广 泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其对了解SA菌株进化、探究种群生物学问题具有重要 的临床价值[95]。方法以探究SA菌株的流行特征迫在眉睫[16,17]。近年来,依据菌株表型或基因型特 征的分型测序方法被广泛应用,如金黄色葡萄球菌A蛋白(Staphylococcal Protein A, SPA) 基因多态性分型、葡萄球菌染色体mec(SCCmec)分型及多位点序列分型(Multilocus Sequencing Typing
浅谈金黄色葡萄球菌 金黄色分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也是调查医院爆发感 染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。目前关于SPA 分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据库中包含了来自世界各地的SA 菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究MRSA 菌株的分子流行病学具有重要意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个管家基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相 应的等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数 据库,其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST 被广泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其对了解SA菌株进化、探究种群生物学问题具有 重要的临床价值[95]。 本研究拟检测及分析上海市儿童医院儿童脓液感染SA菌株的SPA分型、MLST分型及MRSA菌株 的sccMec分型,以了解MRSA感染的流行病学特征。本研究将为临床治疗和预防儿童SA特别 是MRSA感染提供重要的理论依据,具有重要的临床应用价值。 3.2 材料和仪器 3.2.1 菌株来源同第二部分葡萄球菌A蛋分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病 学的研究,也是调查医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且 易于标准化[94]。目前关于SPA分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据 库中包含了来自世界各地的SA菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对 [95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也 是调查医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化 [94]。目前关于SPA分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据库中包含了 来自世界各地的SA菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究MRSA 菌株的分子流行病学具有重要意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个管家基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相 应的等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数 据库,其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST 被广泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其对了解SA菌株进化、探究种群生物学问题具有 重要的临床价值。菌株来源同第二部分现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所 有型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究 MRSA菌株的分子流行病学具有重要意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个管家基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相 应的等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数 据库,其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST 被广泛应用于MRSA菌株的分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也 是调查医院爆发感染的常用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化 [94]。目前关于SPA分型已报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据库中包含了 来自世界各地的SA菌株的数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分SCCmec I~V型,基本满足临床研究需求,对探究MRSA 菌株的分子流意义。 多位点序列分型(MLST)主要基于SA菌株中7个管家基因(arcC、 aroE、 glpF、gmk、 pta、 tpi 和 yqiL)的单核苷酸变异,每个变异可成为一种等位基因,每个分离株可分别赋予相 应的等位基因图谱,即序列型(Sequence type, ST)[96]。目前,MLST已经建立了全球数 据库,其整合了来自世界各国的SA流行株的遗传数据信息,包含超过 5800种ST 型别。MLST 被广泛应用于MRSA菌株的流行病学研究,其对了解SA菌株进化、探究种群生物学问题具有 重要的临床价值[95]。 本研究拟检测及分析上海市儿童医院儿童脓液感染SA菌株的SPA分型、MLST分型及MRSA菌株 的sccMec分型,以了解MRSA感染的流行病学特征。本研究将为临床治疗和预防儿童SA特别 是MRSA感染提供重要的理论依据,具有重要的临床应用价值。材料和仪器 分型方式,所以其大多应用于小范围或短期流行病学的研究,也是调查医院爆发感染的常 用方法。SPA分型成本低廉,使用方便,简单快速且易于标准化[94]。目前关于SPA分型已 报道的重复序列有803个,有19271个相关型别,数据库中包含了来自世界各地的SA菌株的 数据信息,可以实现世界范围内SA菌株SPA型别的比对[95]。 葡萄球菌染色体mec (SCCmec)是一种可移动遗传元件,是耐药基因插入整合的部位,同 时也是广谱?-内酰胺耐药的决定因素[18]。SA菌株通常是由于获得SCCmec元件而产生耐甲氧 西林的特性。目前已经发现了13种不同类型的SCCmec元件,因此一个PCR反应不够检测所有 型别[6]。目前,多重PCR技术可以区分
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