STAY_SABER STAY_SABER
最喜欢saber
关注数: 48 粉丝数: 452 发帖数: 728 关注贴吧数: 84
高通量测序技术综述 摘要:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation"sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。同时,高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing) 关键字:高通量测序 深度测序 新一代测序应用 正文: 一、测序技术发展现状 根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、Illumina(Solexa)sequencing、ABI SOLiD sequencing、离子半导体测序(Ion semiconductor sequencing)、DNA纳米球测序 (DNA nanoballsequencing)等。 随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(wholetranscriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNAsequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。 二、高通量测序技术的应用 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptomeresequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。 需要特别指出的是第二代测序结合微阵列技术而衍生出来的应用--目标序列捕获测序技术(Targeted Resequencing)。这项技术首先利用微阵列技术合成大量寡核苷酸探针,这些寡核苷酸探针能够与基因组上的特定区域互补结合,从而富集到特定区段,然后用第二代测序技术对这些区段进行测序。目前提供序列捕获的厂家有Agilent和Nimblegen,应用最多的是人全外显子组捕获测序。科学家们目前认为外显子组测序比全基因组重测序更有优势,不仅仅是费用较低,更是因为外显子组测序的数据分析计算量较小,与生物学表型结合更为直接。 目前,高通量测序开始广泛应用于寻找疾病的候选基因上。内梅亨大学的研究人员使用这种方法鉴定出Schinzel-Giedion 综合征中的致病突变,Schinzel-Giedion综合征是一种导致严重的智力缺陷、肿瘤高发以及多种先天性畸形的罕见病。他们使用AgilentSureSelect序列捕获和SOLiD对四位患者的外显子组进行测序,平均覆盖度为43倍,读长为50 nt,每个个体产生了2.7-3GB可作图的序列数据。他们聚焦于全部四位患者都携带变异体的12个基因,最终将候选基因缩小至1个。而贝勒医学院基因组测序中心也计划对15种以上疾病进行研究,包括脑癌、肝癌、胰腺癌、结肠癌、卵巢癌、膀胱癌、心脏病、糖尿病、自闭症以及其他遗传疾病,以更好地理解致病突变以及突变对疾病的影响。前不久刚刚结束的Science杂志年度十大科学突破评选中,外显子组测序名列其中。 三、测序技术总结与展望 第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率,适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补,但是成本昂贵,而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中,454序列片段最长,比较适合对未知基因组从头测序,搭建主体结构,但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454具有通量高、片段短、价位低的特点,可以用于大基因组和小基因组的测序和重测序。Solexa双末端测序(paired-end sequencing)可以为基因组进一步拼接提供定位信息,但是随着反应轮数增加,序列长度和质量均有所下降,而且在阅读AT区时有明显错误倾向。SOLiD基于双碱基编码系统的纠错能力以及较高的测序通量,适合转录本研究以及比较基因组学特别是SNP检测等,但是测序的片段短限制了该技术在基因组拼接中的广泛应用。第三代测序技术目前正在研发阶段,尚未正式投入使用。 参考文献: 论文《新一代测序技术的发展及应用前景》 ,中山大学生科院,《生物技术通报》2010年第10期 论文《新一代高通量测序技术临床应用前景》 ,《广东医学》 ,2010 论文《高通量测序技术及其在微生物研究中的应用》 ,《微生物学报》 ,2011.04 综述《新一代测序-高通量技术》 ,生物谷,2010,03
看了视频我啥也不想说了。。。。 没看过真实动画。。。如果。。。我是说如果那个视频是真的 。。。我想我非得笑喷了,真心扛不住,虽然小时候很喜欢火车侠,也理解制作方没打算让我们看,只打算给00后们看或者10后们看。。。反正,没看过火车侠的一定没觉得高铁侠和岛国的类似。。。不过,额,我真心可以不在意他的相似度有多高,不过。。。那个。。。我发觉我真的看不下去3D混着2D的动画,看完以后那叫一个郁闷啊,有种我宁可看2D的机器猫,也不想看国产2D加3D的高达。。。摆出个姿势都是那么的蛋疼。。。这是给00后们往什么方向引到啊。。。 再说剧情,雷同就雷同吧,其实雷同的东西多得很,没必要这么较真,用我一直在看的柯南来说,最开始的一些剧情,还不是和咱们明代的《二刻拍案惊奇》之类的书有一样的地方,甚至一些案例就被照用了,大家还不是很喜欢,为啥,你想啊,一帮小孩子,谁那么较真,这个是不是照抄啊,只看有没有意思呗。大家觉得是这个理吧,再说了现在若干动画都快成量产了,量产后宫,量产机器人,国产动画,敢做点以前没做过的,我知足了,就希望以后,能看到 国产后宫动漫,它就是真的翻译版,我也看。当然照搬归照搬,一些神作能不糟蹋就别糟蹋了。。。伤人心啊。。。。 说的不对别喷我,大家有理说理。。。
基因工程 第一章绪论 1、基因:就是存在于DNA上承载遗传信息的核苷酸序列,是位于染色体上呈直线排列的遗传物质的最小单位,也是携带遗传信息的结构单位和控制遗传性状的功能单位。 2、基因工程:又称重组DNA技术,分子水平进行遗传操作,将任何生物体(供体)的基因或基因组提出来,或通过人工合成的目的基因,按照先设置好的蓝图,插入质粒或病毒复制子(载体),而形成一杂合分子(DNA重组体),然后将重组体转移到复制子所属的宿主生物体复制,或转移到另一生物体(受体)的细胞内(原核或真核),使之在受体细胞内遗传并使受体细胞获得新的性状。 3、基因工程的三要素:供体、载体、受体 4、基因工程的基本流程: (1)DNA的制备包括从供体生物的基因组分离或人工合成,以获得带有目的基因的DNA片段。 (2)在体外通过限制性核酸内切酶分别分离得到的外源DNA和载体分子进行定点切割,使之片段化或线性化 (3)在体外将含有外源基因的不同来源的DNA片段通过DNA连接酶到载体分子上,构建重组DNA分子。 (4)将重组DNA分子通过一定的方法引入到受体细胞进行扩增和表达,从培养细胞中获得大量细胞繁殖群体。 (5)筛选和鉴定转化细胞,剔除非必需重组体,获得引入的外源基因稳定高效表达的基因工程菌或细胞,即将所需要的阳性克隆挑选出来。 (6)将选出的细胞克隆的基因进一步分研究,并设法使之实现功能蛋白的表达。
市场营销 1市场营销;是个人和组织通过创造并同他人交换价值产品以满足需求和欲望的一种社会性经营管理活动。 2需要:指人所缺乏的,无法创造和没得到某些基本满足的感受状态。 3欲望:由个人文化背景及生活环境的陶冶所表现出的对基本需要的特定追求。 4需求:指有能力并愿意购买某个产品的欲望。 5效用:消费者在购买和使用产品时,对其功能传递的评价效度。 6满意:指顾客对一个产品的可感知的效果与他的期望值相比较后,所形成的愉悦或失望的感觉状况。 7成本:消费者购买产品所付出的金钱,时间,精神和体力。 8市场:一切具有特定的欲望和需求并且愿意和能够以交换来满足此欲望和需求的潜在顾客组成。 9市场营销观念:1传统市场营销观念2现代市场营销观念 10生产观念:消费者总是接受任何他能买到并且买得起的产品。因此,企业应集中精力提高生产效率和扩大分销范围,以便增加产量,降低成本。背景:供不应求;适应条件:供不应求,同质性产品;缺陷:重生产,轻市场;核心:提高生产率,降低成本。 11产品观念:消费者最喜欢高质量,多功能和具有某些特色的产品。因此,企业管理的中心是致力生产优质产品,并不断精益求精。背景:供需基本平衡;适应条件:搞收入群体,奢侈品,易察觉;缺陷:营销近视症—在市场营销管理中缺乏远见,只看到自己产品好,看不到市场的需求在变化,致使企业经营陷入困境;核心:产品质量提高,品牌意识出现。 12推销观念:消费者通常有一种购买惰性或抗衡心理,若听其自然,消费者就不会大量购买本企业的产品,因而营销管理的中心是积极推销和大力促销。背景:供过于求;适应条件:非需求品;核心:推销工具和方法哪种最有效;缺陷:盲目扩大生产,产品积压更严重,虚假广告宣传,引起社会不良反应。 13市场营销观念:企业的一切计划与策略应以消费者为中心,正确确定目标市场的需要与欲望,比竞争者更有效地满足顾客需求。背景:确定目标市场的需求和欲望;核心:以消费者为中心,调研;缺陷:客观社会环境,过度关注消费者需求,丧失生产主动性。 14社会营销观念:企业和组织应该确定目标市场的需要,欲望和利益,然后向顾客提供超值产品和服务,以维护与增进顾客和社会的福利。是对市场营销观念的补充与修正。核心:考查社会的需求,节约资源,减少环境污染。 15市场调研:系统的设计,手机,分析和提出数据资料,一级提出跟公司所面临的特定的营销状况有关的调查研究结构。 16调研的步骤:提出问题,确定目标;制定调研计划;收集信息;分析信息;提出市场调研报告,确定最佳方案。调研实务:1调研对象的方法:a询问法:1访谈法 2 邮寄调查法3电话调查法。B观察法c实验法。2选择调研工具:问卷调查结构:标题、调差问卷说明、被调查者基本情况、调查问卷的内容、编码、调查情况统计。 17市场营销环境:影响企业市场营销活动和营销目标实现的各种因素和条件。宏观环境:一个国家或地区的自然、政治、法律、人口、经济、社会文化、科学技术等能够影响企业营销活动的宏观因素。微观环境:企业内部条件、企业的顾客、竞争者、营销渠道和有关公众等对企业营销活动有直接影响的因素。 18市场分析的方法:1市场机会矩阵图2产品/市场发展分析矩阵3市场吸引力/企业优势分析矩阵。 19企业环境威胁对策:反攻策略:试着限制或扭转不利因素的发展;减轻策略:通过企业改变营销策略,以‘减轻环境威胁’的环境;转移策略:将产品转移到其他市场或他赢利更多的产品行业。 营销信息系统:包括内部报警系统、营销情报系统、营销调研系统、营销分析系统。
植物细胞实验 1.实验室器具洗涤的工艺流程是什么?洗净的判定标准是么? (1)浸泡——刷——冲洗——涮洗(蒸馏水)——干燥——存放(2)干燥和洁 .2.无菌室及培养室的日常维护方法 (1)启用时清洁卫生擦拭无尘(2)定期不定期给予紫外线照射,来苏尔拖地,巴氏消毒液喷雾,氧乙酸消毒 3.外植体消毒的一般程序(菊花、银杏、马铃薯三选一.菊花幼苗(银杏种子)——摘除叶片(剥去壳质中的种皮)——流水冲洗30min——装入消毒瓶中——接种台——75%酒精泡30s倒掉——0.1%升汞泡8-12min(升汞倒入回收瓶)——无菌水3-5遍   马铃薯芽段--75%酒精--无菌水冲洗--0.1%升汞泡5-8min--无菌水3-5遍 4. 简述无菌操作的技术要点(1)杀死规定作业系统(如试管三角瓶培养皿)中的一切微生物,保证无菌(2)作业系统和外界联系之间隔绝一切微生物穿过(用火焰封闭三角瓶和试管的开口,用棉花过滤空气,过滤器过滤水等)(3)在无菌室超净工作台或空气流通较小的环境中接种或者在无法避免的敞开作业中避免不需要的微生物侵入作业系统 5. 简述高压灭菌锅的使用方法。 (1)首先将内层灭菌桶取出,再向外层锅内加入适量的水,使水面与三角搁架相平为宜。 (2)放回灭菌桶,预热后并装入待灭菌物品。注意不要装得太挤,以免防碍蒸汽流通而影响灭菌效果。 (3)加盖,再以两两对称的方式同时旋紧相对的两个螺栓,使螺栓松紧一致,勿使漏气。 (4)打开电源和开关,加热,让压力达到0.05Mpa时打开排气阀,排除锅内的冷空气。待冷空气完全排尽后,关上排气阀,让锅内的温度随蒸汽压力增加而逐渐上升。当锅内压力升到所需压力时,控制热源开关,维持压力记时。121-126℃,20分钟灭菌。 (5)灭菌所需时间到后,切断电源让灭菌锅内温度自然下降, (6)取出的灭菌物 6. 简述污染率、枯死率和诱导率的计算方法。 污染率=污染/总的接种数 枯死率=枯死/未污染数   诱导率=分化出的/未污染的愈伤 7. 请写出MS基本培养基的母液MSⅠ的配置步骤7大量元素无机盐硝酸铵,硝酸钾,磷酸二氢钾,硫酸镁和氯化钙按规定的量扩大20倍称取,分别溶解后混合定容到10000m 8. 银杏愈伤组织提取黄酮的操作要点。 取出愈伤组织-65摄氏度烘干48h磨成粉末 -干粉中加入甲醇-超声-水浴破碎30min-过滤收集滤液-加入Hcl-80水浴回流 9.菊花快繁实验中,在进行生根培养时,为什么要选择1/2MS作为基本培养基? 降低无机盐的浓度从而使渗透压降低提高水势促进芽吸水,反而促进生根 10.简述植物细胞工程实验室里马铃薯脱毒的方法及原理。 原理:(1)热处理   在一定范围内,用高于常温处理可部分或完全钝化植物组织中的某些病毒,而不伤及植物本身(2)茎尖培养   病毒在植物体内分布不均,根尖茎尖部分病毒含量极低或无病毒,以茎尖作为外植体能获得脱毒植株,供繁种生产使用 脱毒方法:茎尖培养结合热处理---将适宜的母株或由块茎萌发的带芽块茎于适当的高温30-38处理数周后,切取顶芽或侧芽,作为茎尖剥离材料于无菌条件下剥离茎尖(带1-3个叶原基的顶端分生组织)接种于适宜的培养基上,诱导茎尖分化成苗,扩增,培养种薯即得原原种,扩繁后制得生产中用于生产 11.简述配方1/2MS+NAA0.1+蔗糖3%+琼脂0.7%,pH5.8的含义及配1L的制备方法。 (1)Ms1减半:25ml Ms2-5 :2.5ml(实际中不减半5ml)其余物质均不减如 NAA1ml 蔗糖30gq琼脂7g pH5.8(2)白色搪瓷杯取蒸馏水700ml煮至冒白气,加入7g琼脂搅拌至融化后再加入30g蔗糖溶解,用移液管分别量取(1)调节pH5.8定容至1L 12.简述配500ml MS+BA0.5+NAA0.2+蔗糖3%+琼脂0.7%,pH5.8的过程。
1 下一页